Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G087540.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7D4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G270800 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
2 Sobic.003G267200 - -
3 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
4 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G175700 - -
6 Sobic.001G107550 - -
7 Sobic.009G210250 - -
8 Sobic.005G045250 - -
9 Sobic.003G030450 - -
10 Sobic.009G077000 - -
11 Sobic.009G064300 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
12 Sobic.008G067000 syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
13 Sobic.002G312500 - -
14 Sobic.001G202450 - -
15 Sobic.010G196466 - -
16 Sobic.001G300301 - -
17 Sobic.003G023450 - -
18 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
19 Sobic.004G077700 - -
20 Sobic.004G242800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic001G270800 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic009G087540--Sobic003G267200 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic009G087540--Sobic004G206600 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic009G087540--Sobic002G012100 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic009G087540--Sobic009G175700 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic009G087540--Sobic001G107550 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic009G087540--Sobic009G210250 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic009G087540--Sobic005G045250 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic009G087540--Sobic003G030450 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic001G270800--Sobic003G330350 Sobic001G270800--Sobic009G175700 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic001G270800--Sobic001G167000 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic001G270800--Sobic004G091900 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G270800--Sobic006G131700 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G270800--Sobic003G064901 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic001G270800--Sobic003G169000 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G270800--Sobic003G233266 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G270800--Sobic009G101500 Sobic003G267200--Sobic004G206600 Sobic003G267200--Sobic009G210250 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic003G267200--Sobic010G196466 Sobic003G267200--Sobic009G087540 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G267200--Sobic008G132500 Sobic002G312500 Sobic002G312500 Sobic003G267200--Sobic002G312500 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic003G267200--Sobic001G016050 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic003G267200--Sobic002G009000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G267200--Sobic001G202450 Sobic004G206600--Sobic010G196466 Sobic004G206600--Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic002G012100 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic001G167000 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic004G206600--Sobic007G141900 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic009G087540 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic004G206600--Sobic009G236900 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic009G175700--Sobic001G270800 Sobic009G175700--Sobic003G330350 Sobic009G175700--Sobic003G233266 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic009G175700--Sobic001G331650 Sobic009G175700--Sobic009G087540 Sobic009G175700--Sobic006G131700 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic009G175700--Sobic001G098700 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic009G175700--Sobic008G040501 Sobic009G175700--Sobic003G169000 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G107550--Sobic009G077000 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic009G210250 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic001G107550--Sobic006G107700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic001G107550--Sobic003G056200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G107550--Sobic003G161900 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G107550--Sobic004G077700 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G107550--Sobic002G358450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G107550--Sobic002G214000 Sobic009G210250--Sobic001G202450 Sobic009G210250--Sobic006G107700 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic009G210250--Sobic001G373850 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic009G210250--Sobic007G090433 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic009G210250--Sobic009G257000 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic009G210250--Sobic001G037033 Sobic009G210250--Sobic002G401533 Sobic009G210250--Sobic001G107550 Sobic009G210250--Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic001G202450 Sobic005G045250--Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic003G030450 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic005G045250--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic003G161900 Sobic005G045250--Sobic002G401533 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic005G045250--Sobic005G019250 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic001G107550
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.