Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G312500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QEF6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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cDNA sequences
Sobic.002G312500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G267200 - -
2 Sobic.003G030450 - -
3 Sobic.010G214150 - -
4 Sobic.005G045250 - -
5 Sobic.001G032400 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G103200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G087540 - -
9 Sobic.001G497400 - -
10 Sobic.009G077000 - -
11 Sobic.002G212900 expressed protein -
12 Sobic.003G023450 - -
13 Sobic.001G278900 - -
14 Sobic.001G202450 - -
15 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
16 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
17 Sobic.003G013300 expressed protein -
18 Sobic.002G312550 - -
19 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G358800 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G312500 Sobic002G312500 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic002G312500--Sobic003G267200 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic002G312500--Sobic003G030450 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic002G312500--Sobic010G214150 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic002G312500--Sobic005G045250 Sobic001G032400 Sobic001G032400 Sobic002G312500--Sobic001G032400 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic002G312500--Sobic004G252300 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G312500--Sobic004G103200 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic002G312500--Sobic009G087540 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic002G312500--Sobic001G497400 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic003G267200--Sobic004G206600 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G267200--Sobic009G210250 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic003G267200--Sobic010G196466 Sobic003G267200--Sobic009G087540 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G267200--Sobic008G132500 Sobic003G267200--Sobic002G312500 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic003G267200--Sobic001G016050 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic003G267200--Sobic002G009000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G267200--Sobic001G202450 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G030450--Sobic001G107550 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic005G045250--Sobic001G202450 Sobic005G045250--Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic003G030450 Sobic005G045250--Sobic001G300301 Sobic005G045250--Sobic001G502801 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic002G214000 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G045250--Sobic003G161900 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic005G045250--Sobic002G401533 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic005G045250--Sobic005G019250 Sobic001G032400--Sobic003G030450 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic001G032400--Sobic006G041200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic001G032400--Sobic004G255550 Sobic002G155800 Sobic002G155800 Sobic001G032400--Sobic002G155800 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic001G032400--Sobic006G279600 Sobic001G032400--Sobic007G115700 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic001G032400--Sobic006G205300 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic001G032400--Sobic003G336550 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic001G032400--Sobic002G204050 Sobic004G252300--Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic009G077000 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G252300--Sobic006G053550 Sobic004G252300--Sobic002G214000 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic004G252300--Sobic004G310350 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G252300--Sobic009G215100 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G252300--SobicK031900 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic004G252300--Sobic007G042700 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G252300--Sobic010G219200 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic004G103200--Sobic001G499350 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic004G103200--Sobic002G212900 SobicK043700 SobicK043700 Sobic004G103200--SobicK043700 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic004G103200--Sobic002G129900 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic004G103200--Sobic003G368550 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic004G103200--Sobic005G231000 Sobic004G103200--Sobic004G252300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G103200--Sobic004G183701 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic004G103200--Sobic007G056300 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic003G267200 Sobic009G087540--Sobic004G206600 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic009G087540--Sobic002G012100 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic009G087540--Sobic009G175700 Sobic009G087540--Sobic001G107550 Sobic009G087540--Sobic009G210250 Sobic009G087540--Sobic005G045250 Sobic009G087540--Sobic003G030450 Sobic001G497400--Sobic004G252300 Sobic001G497400--Sobic007G042700 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic001G497400--Sobic002G000350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G497400--Sobic001G278900 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic001G497400--Sobic008G129500 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic001G497400--Sobic003G085533 Sobic001G497400--Sobic004G310350 Sobic001G497400--Sobic009G077000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic001G497400--Sobic004G072300
Octagon: transcription factors


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