Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G032400.1
Synonym Sb01g003030, RLK
Functional annotation lectin-like receptor kinase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QH47
Pfam PF00139 PF00069
Panther DB PTHR27007:SF2 PTHR27007
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004672; protein kinase activity GO:0005524ATP binding GO:0006468protein phosphorylation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37710 : receptor lectin kinase
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g60810.1 : lectin-like receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008358 , Zm00025a008835 , Zm00025a008837
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G114100.1 , HORVU5Hr1G114030.1 , HORVU5Hr1G114030.2 , HORVU5Hr1G114030.3 , HORVU5Hr1G114030.4 , HORVU5Hr1G104840.1 , HORVU5Hr1G104840.2 , HORVU2Hr1G091360.3 , HORVU2Hr1G091360.2 , HORVU2Hr1G091360.1 , HORVU5Hr1G104850.2 , HORVU5Hr1G104850.1
Wheat TraesCS5A02G484600 , TraesCS2D02G129100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.008G067000 syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
20 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G032400 Sobic001G032400 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic001G032400--Sobic003G030450 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic001G032400--Sobic006G041200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic001G032400--Sobic004G255550 Sobic002G155800 Sobic002G155800 Sobic001G032400--Sobic002G155800 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic001G032400--Sobic006G279600 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic001G032400--Sobic007G115700 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic001G032400--Sobic006G205300 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic001G032400--Sobic003G336550 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic001G032400--Sobic002G204050 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G030450--Sobic001G107550 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic006G041200--Sobic006G111000 Sobic006G041200--Sobic004G255550 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic003G336550 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic006G041200--Sobic004G084600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic003G219300 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic006G041200--Sobic002G171901 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G041200--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G041200--Sobic004G180950 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic004G255550--Sobic007G078700 Sobic002G155800--Sobic001G032400 Sobic002G155800--Sobic003G030450 Sobic002G155800--Sobic006G279600 Sobic002G155800--Sobic007G115700 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic002G155800--Sobic006G097600 Sobic002G155800--Sobic005G045250 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic002G155800--Sobic001G502801 Sobic003G358800 Sobic003G358800 Sobic002G155800--Sobic003G358800 Sobic002G312500 Sobic002G312500 Sobic002G155800--Sobic002G312500 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic006G279600--Sobic006G162750 Sobic003G169800 Sobic003G169800 Sobic006G279600--Sobic003G169800 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic006G279600--Sobic007G113000 Sobic006G279600--Sobic003G030450 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic006G279600--Sobic001G413300 Sobic006G279600--Sobic007G078700 Sobic006G279600--Sobic005G045250 Sobic006G279600--Sobic007G115700 Sobic006G279600--Sobic001G202450 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic007G115700--Sobic007G023000 Sobic007G115700--Sobic007G113000 Sobic007G115700--Sobic010G169950 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic007G115700--Sobic008G100900 Sobic007G115700--Sobic006G111000 Sobic007G115700--Sobic003G030450 Sobic007G115700--Sobic006G041200 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic007G115700--Sobic001G373850 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic007G115700--Sobic002G142950 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic002G200400 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic006G205300--Sobic002G358450 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G205300--Sobic001G261444 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic006G205300--Sobic001G475950 Sobic006G205300--Sobic010G169950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G205300--Sobic006G107700 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic006G205300--Sobic001G383350 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G205300--SobicK032200 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic002G204050--Sobic006G205300 Sobic002G204050--Sobic010G169950 Sobic002G204050--Sobic002G358450 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic002G204050--Sobic006G016950 Sobic002G204050--Sobic004G183701 Sobic002G204050--Sobic001G475950 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic002G204050--Sobic002G009000 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic002G204050--Sobic001G352633 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic002G204050--Sobic002G401533
Octagon: transcription factors


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