Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G236900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PA02
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G375400 - -
2 Sobic.003G330350 - -
3 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
5 Sobic.001G167000 HEAT repeat family protein, putative, expressed K11492: NCAPG2, condensin-2 complex subunit G2
6 Sobic.004G193350 - -
7 Sobic.004G322650 - -
8 Sobic.004G299850 - -
9 Sobic.006G130100 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G144001 - -
11 Sobic.001G270800 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
12 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G242800 - -
14 Sobic.001G098700 GRAM domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G160433 - -
16 Sobic.003G218950 - -
17 Sobic.010G196466 - -
18 Sobic.004G091900 - -
19 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.001G011600 glutathione S-transferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic009G236900--Sobic003G375400 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic009G236900--Sobic003G330350 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic009G236900--Sobic003G050100 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic009G236900--Sobic004G206600 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic009G236900--Sobic001G167000 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic009G236900--Sobic004G193350 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic009G236900--Sobic004G322650 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic009G236900--Sobic004G299850 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic009G236900--Sobic006G130100 Sobic003G375400--Sobic009G236900 Sobic003G375400--Sobic003G050100 Sobic003G375400--Sobic003G330350 Sobic003G375400--Sobic004G193350 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G375400--Sobic001G270800 Sobic003G375400--Sobic004G322650 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G375400--Sobic003G160433 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G375400--Sobic006G131700 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G375400--Sobic003G160300 Sobic003G330350--Sobic001G270800 Sobic003G330350--Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic006G131700 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G330350--Sobic003G218950 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic003G330350--Sobic001G098700 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic004G091900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G330350--Sobic006G057100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic003G330350--Sobic009G192200 Sobic003G330350--Sobic001G167000 Sobic003G050100--Sobic003G330350 Sobic003G050100--Sobic003G160300 Sobic003G050100--Sobic003G160433 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G050100--Sobic007G085900 Sobic003G050100--Sobic006G057100 Sobic003G050100--Sobic009G192200 Sobic003G050100--Sobic003G218950 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G050100--Sobic005G216900 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G050100--Sobic002G390200 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic004G206600--Sobic010G196466 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic003G267200 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic004G206600--Sobic002G012100 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic001G167000 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic004G206600--Sobic007G141900 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic002G324801 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic004G206600--Sobic009G087540 Sobic004G206600--Sobic009G236900 Sobic001G167000--Sobic002G012100 Sobic001G167000--Sobic004G242800 Sobic001G167000--Sobic001G270800 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G167000--Sobic001G182800 Sobic001G167000--Sobic003G330350 Sobic001G167000--Sobic004G299850 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic010G196466 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic001G167000--Sobic009G102250 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic004G322650--Sobic008G171200 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic004G322650--Sobic001G171700 Sobic004G322650--Sobic003G238750 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic004G322650--Sobic001G278650 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic001G476800 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic004G322650--Sobic001G182900 Sobic004G322650--Sobic005G216900 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic004G322650--Sobic002G157050 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic004G299850--Sobic009G029100 Sobic004G299850--Sobic001G167000 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic004G299850--Sobic003G412500 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic004G299850--Sobic001G011600 Sobic004G299850--Sobic003G330350 Sobic006G258600 Sobic006G258600 Sobic004G299850--Sobic006G258600 Sobic004G299850--Sobic002G012100 Sobic004G299850--Sobic006G130100 Sobic004G299850--Sobic006G131700 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic006G130100--Sobic001G054050 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic006G130100--Sobic010G225400 Sobic006G130100--Sobic001G011600 Sobic006G130100--Sobic002G390200 Sobic006G130100--Sobic003G160300 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G130100--Sobic003G160400 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G130100--Sobic003G113100 Sobic006G130100--Sobic003G218950 Sobic006G130100--Sobic003G050100
Octagon: transcription factors


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