Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G189600.2,Sobic.009G189600.3,Sobic.009G189600.1,Sobic.009G189600.4,Sobic.009G189600.5,Sobic.009G189600.6
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P9F8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G001700 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
2 Sobic.001G065150 - -
3 Sobic.010G127901 - -
4 Sobic.009G216200 - -
5 Sobic.006G089266 - -
6 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
7 Sobic.005G131500 - -
8 Sobic.005G116800 - -
9 Sobic.003G334500 - -
10 Sobic.003G411150 - -
11 Sobic.004G337066 - K04708: 3-dehydrosphinganine reductase
12 Sobic.005G052300 OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G301050 - -
14 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
16 Sobic.002G280800 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G180950 - -
18 Sobic.004G173300 expressed protein -
19 Sobic.001G451150 - -
20 Sobic.006G099400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G189600 Sobic009G189600 Sobic007G001700 Sobic007G001700 Sobic009G189600--Sobic007G001700 Sobic001G065150 Sobic001G065150 Sobic009G189600--Sobic001G065150 Sobic010G127901 Sobic010G127901 Sobic009G189600--Sobic010G127901 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic009G189600--Sobic009G216200 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic009G189600--Sobic006G089266 Sobic009G204700 Sobic009G204700 Sobic009G189600--Sobic009G204700 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic009G189600--Sobic005G131500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic009G189600--Sobic005G116800 Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic009G189600--Sobic003G334500 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic007G001700--Sobic006G192900 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic007G001700--Sobic004G173300 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic007G001700--Sobic004G093800 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic007G001700--Sobic002G307500 Sobic007G001700--Sobic006G089266 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic007G001700--Sobic010G002600 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic007G001700--Sobic006G009200 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic007G001700--Sobic009G253900 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic007G001700--Sobic004G181400 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic001G065150--Sobic008G138850 Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic001G065150--Sobic003G441301 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic001G065150--Sobic010G061400 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G065150--Sobic002G094000 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic001G065150--Sobic010G033750 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G065150--Sobic001G527550 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic001G065150--Sobic009G255400 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic001G065150--Sobic005G019300 Sobic001G065150--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G127901--Sobic006G083050 Sobic003G270650 Sobic003G270650 Sobic010G127901--Sobic003G270650 Sobic010G127901--Sobic001G065150 Sobic010G127901--Sobic005G116800 Sobic007G151250 Sobic007G151250 Sobic010G127901--Sobic007G151250 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G127901--Sobic009G025750 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic010G127901--Sobic010G229025 Sobic009G045400 Sobic009G045400 Sobic010G127901--Sobic009G045400 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic010G127901--Sobic005G165300 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic005G131500 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic009G216200--Sobic002G377501 Sobic009G216200--Sobic009G204700 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic006G089266 Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic009G216200--Sobic006G085601 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic009G216200--Sobic004G267400 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic009G216200--Sobic003G433000 Sobic006G089266--Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic005G131500 Sobic006G089266--Sobic004G173300 Sobic006G089266--Sobic004G093800 Sobic006G089266--Sobic007G001700 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic002G377501 Sobic006G089266--Sobic009G216200 Sobic006G089266--Sobic002G307500 Sobic009G204700--Sobic004G267400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic009G204700--Sobic003G069601 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic009G204700--Sobic006G045601 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G204700--Sobic001G100300 Sobic009G204700--Sobic009G216200 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic009G204700--Sobic009G173700 Sobic009G204700--Sobic003G433000 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic009G204700--Sobic002G374000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic009G204700--Sobic009G235400 Sobic005G131500--Sobic006G089266 Sobic005G131500--Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic004G093800 Sobic005G131500--Sobic004G173300 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic009G216200 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic002G307500 Sobic005G131500--Sobic004G267400 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic003G334500--Sobic008G041500 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic003G334500--Sobic007G179100 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic006G083050 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G334500--Sobic006G214800 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic010G156300 Sobic003G334500--Sobic008G142500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic003G334500--Sobic010G166850
Octagon: transcription factors


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