Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G052300.1
Synonym Sb05g004240
Functional annotation OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PQ90
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78760 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10180.1 : OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G075700 CHASE domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G261766 - -
3 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
4 Sobic.007G151250 - -
5 Sobic.005G116800 - -
6 Sobic.006G099400 - -
7 Sobic.006G083050 - -
8 Sobic.010G166850 - -
9 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
10 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
11 Sobic.005G041150 - -
12 Sobic.001G065150 - -
13 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
14 Sobic.008G108100 - -
15 Sobic.002G022500 - -
16 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
17 Sobic.007G179100 - -
18 Sobic.005G216833 - -
19 Sobic.001G050650 - -
20 Sobic.009G025750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G052300 Sobic005G052300 Sobic005G075700 Sobic005G075700 Sobic005G052300--Sobic005G075700 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G052300--Sobic003G261766 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G052300--Sobic009G115800 Sobic007G151250 Sobic007G151250 Sobic005G052300--Sobic007G151250 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G052300--Sobic005G116800 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G052300--Sobic006G099400 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G052300--Sobic006G083050 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic005G052300--Sobic010G166850 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic005G052300--Sobic005G165300 SobicK032500 SobicK032500 Sobic005G075700--SobicK032500 Sobic005G075700--Sobic010G166850 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic005G075700--Sobic002G022500 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G075700--Sobic001G527550 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G075700--Sobic010G156300 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic005G075700--Sobic001G050650 Sobic005G075700--Sobic005G116800 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic005G075700--Sobic005G119400 Sobic005G075700--Sobic006G083050 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic007G151250--Sobic003G261766 Sobic007G151250--Sobic005G165300 Sobic007G151250--Sobic009G115800 Sobic007G151250--Sobic005G041150 Sobic007G151250--Sobic006G083050 Sobic007G151250--Sobic005G216833 Sobic007G151250--Sobic006G135550 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic007G151250--Sobic009G236150 Sobic007G151250--Sobic008G108100 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic006G099400--Sobic009G115800 Sobic006G099400--Sobic005G041150 Sobic006G099400--Sobic003G261766 Sobic006G099400--Sobic006G159500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic005G116800 Sobic006G099400--Sobic006G135550 Sobic006G099400--Sobic008G108100 Sobic006G099400--Sobic003G267150 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic010G156300 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic009G025750 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic005G165300--Sobic001G334800 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic005G216833 Sobic005G165300--Sobic003G261766 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic009G115800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic005G165300--Sobic006G250350 Sobic005G165300--Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic009G236150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.