Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G151250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RA66
Pfam PF03692
Panther DB PTHR36791 PTHR36791:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02710 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24844.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002580
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G261766 - -
2 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
3 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
4 Sobic.005G041150 - -
5 Sobic.006G083050 - -
6 Sobic.005G216833 - -
7 Sobic.006G135550 - -
8 Sobic.009G236150 - -
9 Sobic.008G108100 - -
10 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
11 Sobic.001G334800 - -
12 Sobic.005G116800 - -
13 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
14 Sobic.010G166850 - -
15 Sobic.009G134700 - -
16 Sobic.004G176550 - -
17 Sobic.007G179100 - -
18 Sobic.010G127901 - -
19 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
20 Sobic.003G270650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G151250 Sobic007G151250 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic007G151250--Sobic003G261766 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic007G151250--Sobic005G165300 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic007G151250--Sobic009G115800 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic007G151250--Sobic005G041150 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic007G151250--Sobic006G083050 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic007G151250--Sobic005G216833 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic007G151250--Sobic006G135550 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic007G151250--Sobic009G236150 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic007G151250--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic005G165300--Sobic001G334800 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic005G216833 Sobic005G165300--Sobic003G261766 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic009G115800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic005G165300--Sobic006G250350 Sobic005G165300--Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic009G236150 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic005G216833--Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic009G115800 Sobic005G216833--Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic003G261766 Sobic005G216833--Sobic003G267150 Sobic005G216833--Sobic006G159500 Sobic005G216833--Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic002G160500 Sobic006G135550--Sobic003G261766 Sobic006G135550--Sobic009G115800 Sobic006G135550--Sobic008G108100 Sobic006G135550--Sobic006G099400 Sobic006G135550--Sobic006G159500 Sobic006G135550--Sobic005G041150 Sobic006G135550--Sobic005G216833 Sobic006G135550--Sobic004G313000 Sobic006G135550--Sobic009G236150 Sobic009G236150--Sobic005G216833 Sobic009G236150--Sobic004G313000 Sobic009G236150--Sobic003G261766 Sobic009G236150--Sobic009G115800 Sobic009G236150--Sobic003G267150 Sobic009G236150--Sobic008G108100 Sobic009G236150--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic003G267150 Sobic008G108100--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic004G313000 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic008G108100--Sobic004G262550
Octagon: transcription factors


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