Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G337066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQP3
Pfam PF00106
Panther DB PTHR24322 PTHR24322:SF568
NCBI CDD KOG1210; Predicted 3-ketosphinganine reductase
KEGG Orthology K04708; 3-dehydrosphinganine reductase
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06060 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g47350.1 : oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032450
Brachypodium KQK00903
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G180950 - -
2 Sobic.006G210266 - -
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18 Sobic.007G059150 - -
19 Sobic.001G432400 expressed protein -
20 Sobic.010G002600 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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