Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G334500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q6R0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G041500 - -
2 Sobic.007G179100 - -
3 Sobic.009G134700 - -
4 Sobic.006G083050 - -
5 Sobic.006G214800 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G180950 - -
7 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
8 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
9 Sobic.010G166850 - -
10 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
11 Sobic.009G035000 expressed protein -
12 Sobic.010G002600 methyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.010G229025 - -
14 Sobic.010G207175 - -
15 Sobic.009G025800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@tetraspanin family protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G116800 - -
17 Sobic.009G025750 - -
18 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
19 Sobic.005G041150 - -
20 Sobic.003G261766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic003G334500--Sobic008G041500 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic003G334500--Sobic007G179100 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic009G134700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G334500--Sobic006G083050 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G334500--Sobic006G214800 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic001G180950 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic003G334500--Sobic010G156300 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G334500--Sobic008G142500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic003G334500--Sobic010G166850 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G041500--Sobic009G035000 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic008G041500--Sobic003G282400 Sobic008G041500--Sobic007G179100 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic008G041500--Sobic010G002600 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic008G041500--Sobic002G062400 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic008G041500--Sobic001G163500 Sobic008G041500--Sobic010G156300 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic008G041500--Sobic003G129700 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic008G041500--Sobic007G045750 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic007G179100--Sobic002G022500 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic005G041150 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic009G134700--Sobic006G159500 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic009G115800 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic006G083050 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G134700--Sobic005G216833 Sobic009G134700--Sobic007G179100 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic002G319900 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic009G134700--Sobic004G313000 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic006G214800--Sobic003G334500 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic006G214800--Sobic006G210266 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic006G214800--Sobic006G243300 Sobic006G214800--Sobic010G207175 Sobic007G020400 Sobic007G020400 Sobic006G214800--Sobic007G020400 Sobic006G214800--Sobic001G180950 Sobic001G432400 Sobic001G432400 Sobic006G214800--Sobic001G432400 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic006G214800--Sobic003G013300 Sobic006G214800--Sobic007G179100 Sobic001G180950--Sobic002G022500 SobicK032500 SobicK032500 Sobic001G180950--SobicK032500 Sobic001G180950--Sobic010G166850 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G180950--Sobic001G527550 Sobic001G180950--Sobic009G025750 Sobic001G180950--Sobic010G156300 Sobic001G180950--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic001G180950--Sobic009G258800 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic001G180950--Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic010G156300 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic009G025750
Octagon: transcription factors


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