Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G023500.1,Sobic.010G023500.2
Synonym Sb10g002200
Functional annotation von Willebrand factor type A domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VR50 , A0A1W0VR56
Pfam PF13768
Panther DB PTHR10579 PTHR10579:SF57
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54780 : Zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46000.1 : von Willebrand factor type A domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050144 , Zm00025a041417 , Zm00025a041425 , Zm00025a041427
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G183200 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G096400 expressed protein -
3 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
4 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
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12 Sobic.005G153100 - -
13 Sobic.005G131100 expressed protein -
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15 Sobic.008G188300 - -
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18 Sobic.001G505400 expressed protein -
19 Sobic.005G080700 - -
20 Sobic.010G039600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G023500 Sobic010G023500 Sobic001G183200 Sobic001G183200 Sobic010G023500--Sobic001G183200 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic010G023500--Sobic002G096400 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic010G023500--Sobic008G181600 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic010G023500--Sobic001G345600 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic010G023500--Sobic001G312200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic010G023500--Sobic005G152400 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic010G023500--Sobic005G064300 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic010G023500--Sobic001G200800 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic010G023500--Sobic001G345700 Sobic001G183200--Sobic001G200800 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic001G183200--Sobic002G103000 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic001G183200--Sobic001G209701 Sobic002G096400--Sobic005G064300 Sobic002G096400--Sobic008G181600 Sobic002G096400--Sobic001G345700 Sobic002G096400--Sobic001G345600 Sobic002G096400--Sobic005G152400 Sobic002G096400--Sobic001G312200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic002G332000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic002G096400--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic002G096400--Sobic005G131100 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic001G345600--Sobic001G312200 Sobic001G345600--Sobic008G122300 Sobic001G345600--Sobic005G131100 Sobic001G345600--Sobic008G181600 Sobic001G345600--Sobic002G332000 Sobic001G345600--Sobic001G345700 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic001G345600--Sobic005G153100 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic001G345600--Sobic001G505400 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G345600--Sobic005G080700 Sobic001G312200--Sobic005G153100 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic005G131100 Sobic001G312200--Sobic008G122300 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic001G505400 Sobic001G312200--Sobic005G080700 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic001G312200--Sobic002G031200 Sobic005G152400--Sobic001G312200 Sobic005G152400--Sobic005G153100 Sobic005G152400--Sobic001G345600 Sobic004G015200 Sobic004G015200 Sobic005G152400--Sobic004G015200 Sobic005G152400--Sobic002G399700 Sobic005G152400--Sobic008G122300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic005G131100 Sobic005G152400--Sobic002G332000 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic001G200800--Sobic002G103000 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic001G200800--Sobic008G143200 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic001G200800--Sobic010G121800 Sobic001G200800--Sobic002G332000 Sobic001G200800--Sobic001G209701 Sobic001G345700--Sobic008G181600 Sobic001G345700--Sobic005G064300 Sobic001G345700--Sobic001G345600 Sobic001G345700--Sobic002G096400 Sobic001G345700--Sobic001G312200 Sobic001G345700--Sobic008G122300 Sobic001G345700--Sobic010G039600 Sobic001G345700--Sobic005G152400 Sobic001G345700--Sobic005G131100
Octagon: transcription factors


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