Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G062400.1
Synonym Sb10g005410
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YHN5
Pfam -
Panther DB PTHR33743 PTHR33743:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049808
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G222600 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
4 Sobic.005G097900 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
5 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
7 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
8 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G066366 - -
10 Sobic.005G060200 cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.007G154100 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G272600 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
13 Sobic.005G216600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G293100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.003G079100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@muconate cycloisomerase, putative, expressed -
16 Sobic.001G415100 terpene synthase, putative, expressed -
17 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
18 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.005G182800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G014700 domain of unknown function, DUF250 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G062400 Sobic010G062400 Sobic002G222600 Sobic002G222600 Sobic010G062400--Sobic002G222600 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic010G062400--Sobic005G197400 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic010G062400--Sobic010G242800 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G062400--Sobic005G097900 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic010G062400--Sobic005G197500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic010G062400--Sobic004G009200 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic010G062400--Sobic008G033100 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic010G062400--Sobic005G182900 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic010G062400--Sobic005G066366 Sobic003G001300 Sobic003G001300 Sobic002G222600--Sobic003G001300 Sobic009G208700 Sobic009G208700 Sobic002G222600--Sobic009G208700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic002G222600--Sobic007G154100 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic002G222600--Sobic003G282300 Sobic008G077900 Sobic008G077900 Sobic002G222600--Sobic008G077900 Sobic010G152300 Sobic010G152300 Sobic002G222600--Sobic010G152300 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic002G222600--Sobic001G271300 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic002G222600--Sobic006G092100 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic002G222600--Sobic001G293100 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic005G097900--Sobic001G293100 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic005G097900--Sobic007G015000 Sobic005G097900--Sobic008G033100 Sobic005G097900--Sobic002G029500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic005G097900--Sobic001G415100 Sobic005G097900--Sobic010G242800 Sobic005G097900--Sobic005G182900 Sobic005G097900--Sobic007G064900 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic005G097900--Sobic004G299500 Sobic005G197500--Sobic005G197400 Sobic005G197500--Sobic004G009200 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic005G197500--Sobic005G060200 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic005G197500--Sobic004G002901 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic005G197500--Sobic010G268700 Sobic005G197500--Sobic005G182900 Sobic005G197500--Sobic001G271300 Sobic005G197500--Sobic010G242800 Sobic005G197500--Sobic008G033100 Sobic004G009200--Sobic005G197400 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic004G009200--Sobic010G152500 Sobic004G009200--Sobic005G197500 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic004G009200--Sobic003G382200 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic004G009200--Sobic009G106100 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic004G009200--Sobic005G106300 Sobic004G009200--Sobic007G154100 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic004G009200--Sobic005G182800 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic004G009200--Sobic007G015100 Sobic008G033100--Sobic010G242800 Sobic008G033100--Sobic005G182900 Sobic008G033100--Sobic001G293100 Sobic008G033100--Sobic003G161400 Sobic008G033100--Sobic005G097900 Sobic008G033100--Sobic002G019000 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic002G029500 Sobic008G033100--Sobic001G415100 Sobic005G182900--Sobic008G033100 Sobic005G182900--Sobic002G019000 Sobic005G182900--Sobic010G242800 Sobic005G182900--Sobic002G029500 Sobic005G182900--Sobic001G415100 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G182900--Sobic005G065700 Sobic005G182900--Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic003G161400 Sobic005G182900--Sobic001G293100 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic003G161400
Octagon: transcription factors


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