Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G066366.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHF3
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31640.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012780 , Zm00025a012777 , Zm00025a012766 , Zm00025a012769 , Zm00025a012779
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
2 Sobic.005G110511 - -
3 Sobic.005G197350 - -
4 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
6 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
10 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
11 Sobic.002G081850 - -
12 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.005G097900 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
14 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
15 Sobic.001G293100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.005G216600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
18 Sobic.005G110508 - -
19 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
20 Sobic.002G029500 cytochrome P450 84A1, putative, expressed K09755: CYP84A, ferulate-5-hydroxylase


Gene co-expression network
sample Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic008G033100--Sobic010G242800 Sobic008G033100--Sobic005G182900 Sobic008G033100--Sobic001G293100 Sobic008G033100--Sobic003G161400 Sobic008G033100--Sobic005G097900 Sobic008G033100--Sobic002G019000 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic002G029500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic008G033100--Sobic001G415100 Sobic005G197500--Sobic005G197400 Sobic005G197500--Sobic004G009200 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic005G197500--Sobic005G060200 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic005G197500--Sobic004G002901 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic005G197500--Sobic010G268700 Sobic005G197500--Sobic005G182900 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic005G197500--Sobic001G271300 Sobic005G197500--Sobic010G242800 Sobic005G197500--Sobic008G033100 Sobic005G182900--Sobic008G033100 Sobic005G182900--Sobic002G019000 Sobic005G182900--Sobic010G242800 Sobic005G182900--Sobic002G029500 Sobic005G182900--Sobic001G415100 Sobic005G182900--Sobic005G065700 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic003G161400 Sobic005G182900--Sobic001G293100 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic003G161400--Sobic008G033100 Sobic003G161400--Sobic010G242800 Sobic003G161400--Sobic001G293100 Sobic003G161400--Sobic005G182900 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic003G161400--Sobic007G015000 Sobic003G161400--Sobic010G268700 Sobic003G161400--Sobic010G213600 Sobic003G161400--Sobic001G415100 Sobic003G161400--Sobic005G097900
Octagon: transcription factors


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