Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G081850.3,Sobic.002G081850.1,Sobic.002G081850.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2Y7
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46730 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36690.1 : mla1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G197350 - -
2 Sobic.005G066366 - -
3 Sobic.005G110511 - -
4 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G081800 RGH1A, putative, expressed -
7 Sobic.002G411000 AP2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
9 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
11 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
12 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G108300 expressed protein -
14 Sobic.005G110508 - -
15 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
16 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
18 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
19 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
20 Sobic.003G079100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@muconate cycloisomerase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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