Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G081800.3,Sobic.002G081800.2
Synonym
Functional annotation RGH1A, putative, expressed
UniProt A0A1B6QA07
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43470 : Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36690.1 : mla1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G023820.2 , HORVU7Hr1G023820.3 , HORVU7Hr1G023820.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G081850 - -
2 Sobic.005G022200 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
3 Sobic.005G110511 - -
4 Sobic.005G066366 - -
5 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
6 Sobic.005G197350 - -
7 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
8 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.004G339800 phosphate transporter 1, putative, expressed -
10 Sobic.010G213600 histidine kinase, putative, expressed -
11 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
12 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
14 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
16 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
17 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G083800 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G015100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.006G108300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic002G081800--Sobic002G081850 Sobic005G022200 Sobic005G022200 Sobic002G081800--Sobic005G022200 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic002G081800--Sobic005G110511 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic002G081800--Sobic005G066366 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic002G081800--Sobic010G242800 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic002G081800--Sobic005G197350 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic002G081800--Sobic003G161400 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic002G081800--Sobic005G066500 Sobic004G339800 Sobic004G339800 Sobic002G081800--Sobic004G339800 Sobic002G081850--Sobic005G197350 Sobic002G081850--Sobic005G066366 Sobic002G081850--Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G066500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic002G081850--Sobic005G066300 Sobic002G081850--Sobic002G081800 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic002G081850--Sobic002G411000 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic002G081850--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic002G081850--Sobic005G065700 Sobic005G022200--Sobic002G081800 Sobic005G022200--Sobic002G081850 Sobic005G022200--Sobic003G161400 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G022200--Sobic010G213600 Sobic005G022200--Sobic010G242800 Sobic005G022200--Sobic005G066366 Sobic005G022200--Sobic005G197350 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G022200--Sobic008G033100 Sobic005G022200--Sobic004G339800 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic003G161400--Sobic008G033100 Sobic003G161400--Sobic010G242800 Sobic003G161400--Sobic001G293100 Sobic003G161400--Sobic005G182900 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic003G161400--Sobic007G015000 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic003G161400--Sobic010G268700 Sobic003G161400--Sobic010G213600 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic003G161400--Sobic001G415100 Sobic003G161400--Sobic005G097900 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic004G339800--Sobic003G079100 Sobic004G339800--Sobic002G029500 Sobic002G197000 Sobic002G197000 Sobic004G339800--Sobic002G197000 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic004G339800--Sobic003G083800 Sobic004G339800--Sobic005G110511 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic004G339800--Sobic006G108300 Sobic004G339800--Sobic007G064900 Sobic009G084400 Sobic009G084400 Sobic004G339800--Sobic009G084400 Sobic004G339800--Sobic004G312500
Octagon: transcription factors


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