Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G066500.1
Synonym Sb05g005640
Functional annotation glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6PQJ4
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31640.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012780 , Zm00025a012777 , Zm00025a012766 , Zm00025a012769 , Zm00025a012779
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110511 - -
2 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
4 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
5 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
6 Sobic.005G197350 - -
7 Sobic.006G009700 expressed protein -
8 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
9 Sobic.002G411000 AP2 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G238700 - -
11 Sobic.005G066366 - -
12 Sobic.007G119750 - -
13 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
14 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
15 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G110508 - -
17 Sobic.002G081850 - -
18 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
19 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.006G108300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic005G071900--Sobic002G029600 Sobic008G138700--Sobic006G009700 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic005G066500 Sobic008G138700--Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G110511 Sobic008G138700--Sobic005G071900 Sobic008G138700--Sobic004G312500 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic010G213600 Sobic004G312500--Sobic005G071900 Sobic004G312500--Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic005G110511 Sobic004G312500--Sobic006G009700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic005G066500 Sobic004G312500--Sobic008G138700 Sobic004G312500--Sobic005G065700 Sobic004G312500--Sobic002G411000 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic006G009700--Sobic008G138700 Sobic006G009700--Sobic004G312500 Sobic006G009700--Sobic005G071900 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic006G009700--Sobic002G019100 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic006G009700--Sobic004G126500 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic006G009700--Sobic001G238500 Sobic006G009700--Sobic005G066500 Sobic002G238700 Sobic002G238700 Sobic006G009700--Sobic002G238700 Sobic006G009700--Sobic006G108300 Sobic002G019000--Sobic005G182900 Sobic002G019000--Sobic005G065700 Sobic002G019000--Sobic008G033100 Sobic002G019000--Sobic010G213600 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic010G242800 Sobic002G019000--Sobic002G029500 Sobic002G019000--Sobic007G064900 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic002G019000--Sobic003G161400 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic002G411000--Sobic005G066300 Sobic002G411000--Sobic006G108300 Sobic002G411000--Sobic004G312500 Sobic002G411000--Sobic005G071900 Sobic002G411000--Sobic006G009700 Sobic002G411000--Sobic005G066500 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic002G411000--Sobic001G506700 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic002G411000--Sobic001G506600 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic002G411000--Sobic010G274400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.