Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110508.1,Sobic.005G110508.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIF8 , C6JS17 , A0A1Z5RI28 , C6JS16 , A0A109NDG0 , A0A109NDI6
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF618
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46530 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14830.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029118
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110511 - -
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3 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
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10 Sobic.002G081850 - -
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13 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
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20 Sobic.009G106100 GCRP9 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G110508--Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110508--Sobic005G066500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic004G312500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066300 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110508--Sobic005G066366 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110508--Sobic005G071900 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic002G411000 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G197350 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic005G110508--Sobic005G079400 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic004G312500--Sobic005G071900 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic005G110511 Sobic004G312500--Sobic006G009700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic005G066500 Sobic004G312500--Sobic008G138700 Sobic004G312500--Sobic005G065700 Sobic004G312500--Sobic002G411000 Sobic005G066300--Sobic002G411000 Sobic005G066300--Sobic004G312500 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic005G066300--Sobic001G506700 Sobic005G066300--Sobic005G071900 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic005G197350 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic006G209000 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G066300--Sobic002G081850 Sobic005G066300--Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic005G071900--Sobic002G029600 Sobic002G411000--Sobic005G066300 Sobic002G411000--Sobic006G108300 Sobic002G411000--Sobic004G312500 Sobic002G411000--Sobic005G071900 Sobic002G411000--Sobic006G009700 Sobic002G411000--Sobic005G066500 Sobic002G411000--Sobic001G506700 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic002G411000--Sobic001G506600 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic002G411000--Sobic010G274400 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic005G079400--Sobic009G106100
Octagon: transcription factors


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