Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G079400.1
Synonym HDA6, SIL1, ATHDA6, RPD3B, AXE1, Sb05g006480, RTS1
Functional annotation histone deacetylase 19, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RH95
Pfam PF00850
Panther DB PTHR10625 PTHR10625:SF126
NCBI CDD -
KEGG Orthology K06067; histone deacetylase 1/2
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G63110 : histone deacetylase 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g40400.1 : histone deacetylase 19, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G077760.1 , HORVU5Hr1G077800.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic005G110508--Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110508--Sobic005G066500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066366 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110508--Sobic005G071900 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G079400 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic005G066300--Sobic002G411000 Sobic005G066300--Sobic004G312500 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic005G066300--Sobic001G506700 Sobic005G066300--Sobic005G071900 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic005G197350 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic002G081850 Sobic005G066300--Sobic005G066500 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic002G081850--Sobic005G197350 Sobic002G081850--Sobic005G066366 Sobic002G081850--Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G066500 Sobic002G081850--Sobic005G066300 Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G411000 Sobic002G081850--Sobic004G312500 Sobic002G081850--Sobic005G065700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic002G376100--Sobic007G154100 Sobic002G376100--Sobic004G009200 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic002G376100--Sobic002G391900 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic002G376100--Sobic010G152500 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic002G376100--Sobic003G382200 Sobic002G376100--Sobic005G066300 Sobic002G376100--Sobic009G106100 Sobic002G376100--Sobic005G071900 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic002G376100--Sobic006G108300 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic009G106100--Sobic003G083800 Sobic009G106100--Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic004G009200 Sobic009G106100--Sobic003G382200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic005G106300 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic009G106100--Sobic007G111800 Sobic009G106100--Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G197400
Octagon: transcription factors


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