Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G228600.2
Synonym Sb04g027300
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNP3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G378500 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G002901 - K02940: RP-L9e, large subunit ribosomal protein L9e
3 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G066366 - -
5 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -
7 Sobic.005G060200 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
9 Sobic.005G202800 - -
10 Sobic.002G025500 expressed protein -
11 Sobic.003G443700 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
12 Sobic.009G106100 GCRP9 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed -
13 Sobic.007G111800 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
14 Sobic.005G069500 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.004G346300 expressed protein -
16 Sobic.005G206000 dirigent, putative, expressed -
17 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
18 Sobic.002G391900 peroxidase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.003G083800 DNA binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G162400 GATA transcription factor 25, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G228600 Sobic004G228600 Sobic001G378500 Sobic001G378500 Sobic004G228600--Sobic001G378500 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic004G228600--Sobic004G002901 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic004G228600--Sobic005G197500 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic004G228600--Sobic005G066366 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic004G228600--Sobic005G197400 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic004G228600--Sobic010G268700 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic004G228600--Sobic005G060200 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic004G228600--Sobic004G009200 Sobic005G202800 Sobic005G202800 Sobic004G228600--Sobic005G202800 Sobic001G378500--Sobic004G228600 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic001G378500--Sobic003G443700 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic001G378500--Sobic002G025500 Sobic001G378500--Sobic004G002901 Sobic007G064500 Sobic007G064500 Sobic001G378500--Sobic007G064500 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic001G378500--Sobic004G346300 Sobic007G177400 Sobic007G177400 Sobic001G378500--Sobic007G177400 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic001G378500--Sobic007G111800 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic001G378500--Sobic009G106100 Sobic004G002901--Sobic005G060200 Sobic004G002901--Sobic005G197500 Sobic004G002901--Sobic010G268700 Sobic004G002901--Sobic004G346300 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic004G002901--Sobic001G271300 Sobic004G002901--Sobic007G111800 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic004G002901--Sobic007G212000 Sobic010G245400 Sobic010G245400 Sobic004G002901--Sobic010G245400 Sobic004G002901--Sobic003G443700 Sobic005G197500--Sobic005G197400 Sobic005G197500--Sobic004G009200 Sobic005G197500--Sobic005G060200 Sobic005G197500--Sobic004G002901 Sobic005G197500--Sobic010G268700 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G197500--Sobic005G182900 Sobic005G197500--Sobic001G271300 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G197500--Sobic010G242800 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G197500--Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic010G268700--Sobic006G097900 Sobic010G268700--Sobic005G060200 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic010G268700--Sobic001G301000 Sobic010G268700--Sobic005G216600 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G268700--Sobic001G293100 Sobic010G268700--Sobic005G197500 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic010G268700--Sobic008G010500 Sobic010G268700--Sobic004G002901 Sobic010G268700--Sobic003G161400 Sobic005G060200--Sobic010G268700 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic005G060200--Sobic005G216400 Sobic005G060200--Sobic004G002901 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic005G060200--Sobic006G121000 Sobic005G060200--Sobic005G197500 Sobic005G060200--Sobic007G212000 Sobic005G060200--Sobic003G443700 Sobic002G178101 Sobic002G178101 Sobic005G060200--Sobic002G178101 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic005G060200--Sobic007G015000 Sobic004G009200--Sobic005G197400 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic004G009200--Sobic010G152500 Sobic004G009200--Sobic005G197500 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic004G009200--Sobic003G382200 Sobic004G009200--Sobic009G106100 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic004G009200--Sobic005G106300 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G009200--Sobic007G154100 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic004G009200--Sobic005G182800 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic004G009200--Sobic007G015100 Sobic005G202800--Sobic004G002901 Sobic005G105700 Sobic005G105700 Sobic005G202800--Sobic005G105700 Sobic003G023600 Sobic003G023600 Sobic005G202800--Sobic003G023600 Sobic005G202800--Sobic004G228600 Sobic006G015300 Sobic006G015300 Sobic005G202800--Sobic006G015300 Sobic005G202800--Sobic007G177400 Sobic005G202800--Sobic004G346300 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic005G202800--Sobic009G095800 Sobic005G202800--Sobic002G025500
Octagon: transcription factors


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