Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G202800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTQ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G002901 - K02940: RP-L9e, large subunit ribosomal protein L9e
2 Sobic.005G105700 beta,beta-carotene 9,10-dioxygenase, putative, expressed K17913: carlactone synthase / all-trans-10'-apo-beta-carotenal 13,14-cleaving dioxygenase
3 Sobic.003G023600 peptide-N4-asparagine amidase A, putative, expressed -
4 Sobic.004G228600 - -
5 Sobic.006G015300 expressed protein -
6 Sobic.007G177400 OsFBX306 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G346300 expressed protein -
8 Sobic.009G095800 DUF623 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G025500 expressed protein -
10 Sobic.005G206000 dirigent, putative, expressed -
11 Sobic.005G177100 glycosyl hydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.005G162400 GATA transcription factor 25, putative, expressed -
13 Sobic.005G060200 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.003G443700 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
15 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G378500 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G111800 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
18 Sobic.007G212000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.010G245400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.003G075566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G202800 Sobic005G202800 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic005G202800--Sobic004G002901 Sobic005G105700 Sobic005G105700 Sobic005G202800--Sobic005G105700 Sobic003G023600 Sobic003G023600 Sobic005G202800--Sobic003G023600 Sobic004G228600 Sobic004G228600 Sobic005G202800--Sobic004G228600 Sobic006G015300 Sobic006G015300 Sobic005G202800--Sobic006G015300 Sobic007G177400 Sobic007G177400 Sobic005G202800--Sobic007G177400 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic005G202800--Sobic004G346300 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic005G202800--Sobic009G095800 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic005G202800--Sobic002G025500 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic004G002901--Sobic005G060200 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic004G002901--Sobic005G197500 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic004G002901--Sobic010G268700 Sobic004G002901--Sobic004G346300 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic004G002901--Sobic001G271300 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic004G002901--Sobic007G111800 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic004G002901--Sobic007G212000 Sobic010G245400 Sobic010G245400 Sobic004G002901--Sobic010G245400 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic004G002901--Sobic003G443700 Sobic005G105700--Sobic007G177400 Sobic005G105700--Sobic006G015300 Sobic005G105700--Sobic004G002901 Sobic005G105700--Sobic003G023600 Sobic005G105700--Sobic005G202800 Sobic005G105700--Sobic004G346300 Sobic003G419200 Sobic003G419200 Sobic005G105700--Sobic003G419200 Sobic005G105700--Sobic010G245400 Sobic005G162400 Sobic005G162400 Sobic005G105700--Sobic005G162400 Sobic003G023600--Sobic004G346300 Sobic003G023600--Sobic007G212000 Sobic003G023600--Sobic007G177400 Sobic003G023600--Sobic004G002901 Sobic001G181600 Sobic001G181600 Sobic003G023600--Sobic001G181600 Sobic003G023600--Sobic007G111800 Sobic003G154500 Sobic003G154500 Sobic003G023600--Sobic003G154500 Sobic003G357700 Sobic003G357700 Sobic003G023600--Sobic003G357700 Sobic003G023600--Sobic005G105700 Sobic001G378500 Sobic001G378500 Sobic004G228600--Sobic001G378500 Sobic004G228600--Sobic004G002901 Sobic004G228600--Sobic005G197500 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic004G228600--Sobic005G066366 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic004G228600--Sobic005G197400 Sobic004G228600--Sobic010G268700 Sobic004G228600--Sobic005G060200 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic004G228600--Sobic004G009200 Sobic004G228600--Sobic005G202800 Sobic006G015300--Sobic005G105700 Sobic006G015300--Sobic005G162400 Sobic006G015300--Sobic007G177400 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic006G015300--Sobic002G178200 Sobic006G015300--Sobic005G202800 Sobic006G015300--Sobic004G002901 Sobic005G220300 Sobic005G220300 Sobic006G015300--Sobic005G220300 Sobic002G178101 Sobic002G178101 Sobic006G015300--Sobic002G178101 Sobic006G015300--Sobic003G443700 Sobic007G177400--Sobic003G357700 Sobic002G366200 Sobic002G366200 Sobic007G177400--Sobic002G366200 Sobic007G177400--Sobic004G346300 Sobic007G177400--Sobic003G443700 Sobic007G064500 Sobic007G064500 Sobic007G177400--Sobic007G064500 Sobic002G028632 Sobic002G028632 Sobic007G177400--Sobic002G028632 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic007G177400--Sobic005G216400 Sobic007G177400--Sobic003G023600 Sobic007G177400--Sobic002G025500 Sobic004G346300--Sobic003G443700 Sobic004G346300--Sobic003G357700 Sobic004G346300--Sobic005G216400 Sobic004G346300--Sobic005G060200 Sobic004G346300--Sobic007G177400 Sobic004G346300--Sobic004G002901 Sobic004G346300--Sobic007G212000 Sobic004G346300--Sobic003G023600 Sobic004G346300--Sobic002G025500 Sobic009G095800--Sobic010G268700 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic009G095800--Sobic007G015000 Sobic009G095800--Sobic007G111800 Sobic009G095800--Sobic007G212000 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic009G095800--Sobic003G007400 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic009G095800--Sobic005G216600 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic009G095800--Sobic001G293100 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic009G095800--Sobic003G161400 Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic009G095800--Sobic003G255600 Sobic002G025500--Sobic003G443700 Sobic002G025500--Sobic004G346300 Sobic002G025500--Sobic003G357700 Sobic002G025500--Sobic010G268700 Sobic002G025500--Sobic002G366200 Sobic002G025500--Sobic005G060200 Sobic002G025500--Sobic005G216400 Sobic002G025500--Sobic007G177400 Sobic002G025500--Sobic007G111800
Octagon: transcription factors


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