Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110511.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHZ7 , C6JS19 , A0A109NDF7 , C6JS18
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF641
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46530 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40150.1 : RGH2B, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029118
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
3 Sobic.005G066366 - -
4 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
5 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
7 Sobic.002G029500 cytochrome P450 84A1, putative, expressed K09755: CYP84A, ferulate-5-hydroxylase
8 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
9 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
10 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
11 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
13 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G197350 - -
15 Sobic.005G097900 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
16 Sobic.006G108300 expressed protein -
17 Sobic.005G110508 - -
18 Sobic.003G083800 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G009700 expressed protein -
20 Sobic.003G079100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@muconate cycloisomerase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic004G312500--Sobic005G071900 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic005G110511 Sobic004G312500--Sobic006G009700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic005G066500 Sobic004G312500--Sobic008G138700 Sobic004G312500--Sobic005G065700 Sobic004G312500--Sobic002G411000 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic005G071900--Sobic002G029600 Sobic002G029500--Sobic005G182900 Sobic002G029500--Sobic007G064900 Sobic002G029500--Sobic005G097900 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic002G029500--Sobic005G106300 Sobic002G029500--Sobic008G033100 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic002G029500--Sobic002G289500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic002G029500--Sobic001G415100 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic002G029500--Sobic007G015000 Sobic002G082000 Sobic002G082000 Sobic002G029500--Sobic002G082000 Sobic007G064900--Sobic002G029500 Sobic007G064900--Sobic010G242800 Sobic007G064900--Sobic008G033100 Sobic007G064900--Sobic005G097900 Sobic007G064900--Sobic005G182900 Sobic007G064900--Sobic005G110511 Sobic007G064900--Sobic002G019000 Sobic007G064900--Sobic001G415100 Sobic007G064900--Sobic005G065700 Sobic008G033100--Sobic010G242800 Sobic008G033100--Sobic005G182900 Sobic008G033100--Sobic001G293100 Sobic008G033100--Sobic003G161400 Sobic008G033100--Sobic005G097900 Sobic008G033100--Sobic002G019000 Sobic008G033100--Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic002G029500 Sobic008G033100--Sobic001G415100
Octagon: transcription factors


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