Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G138700.2
Synonym RPS3, RPM1
Functional annotation MLA12, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R6L2
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF578
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g17480.1 : MLA12, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G009700 expressed protein -
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12 Sobic.002G019100 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
13 Sobic.003G001300 ZOS1-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
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16 Sobic.006G108300 expressed protein -
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20 Sobic.010G152300 glycosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic008G138700--Sobic006G009700 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic009G060700 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic008G138700--Sobic005G066500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G065700 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic008G138700--Sobic005G110511 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic008G138700--Sobic005G071900 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic008G138700--Sobic004G312500 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic006G092100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic008G138700--Sobic010G213600 Sobic006G009700--Sobic008G138700 Sobic006G009700--Sobic004G312500 Sobic006G009700--Sobic005G071900 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic006G009700--Sobic002G019100 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic006G009700--Sobic004G126500 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic006G009700--Sobic001G238500 Sobic006G009700--Sobic005G066500 Sobic002G238700 Sobic002G238700 Sobic006G009700--Sobic002G238700 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic006G009700--Sobic006G108300 Sobic009G060700--Sobic008G138700 Sobic010G152300 Sobic010G152300 Sobic009G060700--Sobic010G152300 Sobic005G222600 Sobic005G222600 Sobic009G060700--Sobic005G222600 Sobic003G001300 Sobic003G001300 Sobic009G060700--Sobic003G001300 Sobic009G060700--Sobic010G213600 Sobic009G060700--Sobic002G019100 Sobic009G060700--Sobic006G009700 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic009G060700--Sobic003G079100 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic009G060700--Sobic004G008600 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic005G071900--Sobic002G029600 Sobic004G312500--Sobic005G071900 Sobic004G312500--Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic005G110511 Sobic004G312500--Sobic006G009700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic005G066500 Sobic004G312500--Sobic008G138700 Sobic004G312500--Sobic005G065700 Sobic004G312500--Sobic002G411000 Sobic006G092100--Sobic010G213600 Sobic006G092100--Sobic010G152300 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic006G092100--Sobic001G293100 Sobic006G092100--Sobic008G033100 Sobic006G092100--Sobic008G138700 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic006G092100--Sobic005G097900 Sobic006G092100--Sobic005G182900 Sobic006G092100--Sobic002G029500 Sobic006G092100--Sobic002G019000 Sobic010G213600--Sobic008G033100 Sobic010G213600--Sobic005G065700 Sobic010G213600--Sobic002G019000 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic010G213600--Sobic004G014600 Sobic010G213600--Sobic005G182900 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic010G213600--Sobic009G165100 Sobic010G213600--Sobic003G079100 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G213600--Sobic003G161400 Sobic001G342000 Sobic001G342000 Sobic010G213600--Sobic001G342000
Octagon: transcription factors


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