Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G162700.1
Synonym Sb04g021440, IDD2, AtIDD2
Functional annotation ZOS2-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A194YQ55
Pfam -
Panther DB PTHR10593 PTHR10593:SF48
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50700 : indeterminate(ID)-domain 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g31890.1 : ZOS2-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020483
Brachypodium KQJ99656
Barley -
Wheat TraesCS2D02G287500 , TraesCS4D02G294900 , TraesCS2A02G289500 , TraesCS4A02G008900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G003100 nodulin, putative, expressed -
2 Sobic.004G228600 - -
3 Sobic.005G197400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G378500 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
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7 Sobic.009G095800 DUF623 domain containing protein, expressed -
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10 Sobic.005G069500 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
11 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G066366 - -
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14 Sobic.003G382200 methyltransferase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G110514 - -
16 Sobic.008G055700 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
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19 Sobic.001G482000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
20 Sobic.009G006300 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G162700 Sobic004G162700 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic004G162700--Sobic004G003100 Sobic004G228600 Sobic004G228600 Sobic004G162700--Sobic004G228600 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic004G162700--Sobic005G197400 Sobic001G378500 Sobic001G378500 Sobic004G162700--Sobic001G378500 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic004G162700--Sobic009G106100 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic004G162700--Sobic005G079400 Sobic009G095800 Sobic009G095800 Sobic004G162700--Sobic009G095800 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic004G162700--Sobic002G391900 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic004G162700--Sobic004G009200 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic004G003100--Sobic005G110514 Sobic009G233100 Sobic009G233100 Sobic004G003100--Sobic009G233100 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic004G003100--Sobic003G007400 Sobic010G013000 Sobic010G013000 Sobic004G003100--Sobic010G013000 Sobic005G206000 Sobic005G206000 Sobic004G003100--Sobic005G206000 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic004G003100--Sobic004G308500 Sobic004G003100--Sobic009G095800 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic004G003100--Sobic001G301000 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic004G003100--Sobic007G186500 Sobic004G228600--Sobic001G378500 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic004G228600--Sobic004G002901 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic004G228600--Sobic005G197500 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic004G228600--Sobic005G066366 Sobic004G228600--Sobic005G197400 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic004G228600--Sobic010G268700 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic004G228600--Sobic005G060200 Sobic004G228600--Sobic004G009200 Sobic005G202800 Sobic005G202800 Sobic004G228600--Sobic005G202800 Sobic005G197400--Sobic005G197500 Sobic005G197400--Sobic004G009200 Sobic005G197400--Sobic005G066366 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G197400--Sobic005G182900 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G197400--Sobic010G242800 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G197400--Sobic008G033100 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G197400--Sobic005G216600 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197400--Sobic002G019000 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G197400--Sobic005G110511 Sobic001G378500--Sobic004G228600 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic001G378500--Sobic003G443700 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic001G378500--Sobic002G025500 Sobic001G378500--Sobic004G002901 Sobic007G064500 Sobic007G064500 Sobic001G378500--Sobic007G064500 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic001G378500--Sobic004G346300 Sobic007G177400 Sobic007G177400 Sobic001G378500--Sobic007G177400 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic001G378500--Sobic007G111800 Sobic001G378500--Sobic009G106100 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic009G106100--Sobic003G083800 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic004G009200 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic009G106100--Sobic003G382200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic007G111800 Sobic009G106100--Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G197400 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic009G095800--Sobic010G268700 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic009G095800--Sobic007G015000 Sobic009G095800--Sobic007G111800 Sobic007G212000 Sobic007G212000 Sobic009G095800--Sobic007G212000 Sobic009G095800--Sobic003G007400 Sobic009G095800--Sobic005G216600 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic009G095800--Sobic001G293100 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic009G095800--Sobic003G161400 Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic009G095800--Sobic003G255600 Sobic002G391900--Sobic003G382200 Sobic002G391900--Sobic010G152500 Sobic002G391900--Sobic004G009200 Sobic002G391900--Sobic009G106100 Sobic005G069500 Sobic005G069500 Sobic002G391900--Sobic005G069500 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic002G391900--Sobic006G097900 Sobic002G391900--Sobic005G216600 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic002G391900--Sobic006G031100 Sobic006G224500 Sobic006G224500 Sobic002G391900--Sobic006G224500 Sobic004G009200--Sobic005G197400 Sobic004G009200--Sobic010G152500 Sobic004G009200--Sobic005G197500 Sobic004G009200--Sobic003G382200 Sobic004G009200--Sobic009G106100 Sobic004G009200--Sobic005G106300 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G009200--Sobic007G154100 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic004G009200--Sobic005G182800 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic004G009200--Sobic007G015100
Octagon: transcription factors


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