Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G119750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9J8
Pfam -
Panther DB PTHR11439 PTHR11439:SF192
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G43590 : zinc knuckle (CCHC-type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45890.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G066200 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G197350 - -
3 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
5 Sobic.010G126800 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
6 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
8 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
9 Sobic.005G110511 - -
10 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
11 Sobic.005G066366 - -
12 Sobic.010G213600 histidine kinase, putative, expressed -
13 Sobic.004G120000 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G226400 RGH1A, putative, expressed -
16 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
17 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
18 Sobic.002G238700 - -
19 Sobic.002G063700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G004900 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1


Gene co-expression network
sample Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic007G119750--Sobic005G066200 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic007G119750--Sobic005G197350 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic007G119750--Sobic005G066500 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic007G119750--Sobic002G019000 Sobic010G126800 Sobic010G126800 Sobic007G119750--Sobic010G126800 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic007G119750--Sobic005G065700 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic007G119750--Sobic010G242800 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic007G119750--Sobic007G064900 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic007G119750--Sobic005G110511 Sobic005G066200--Sobic007G119750 Sobic005G066200--Sobic005G197350 Sobic005G066200--Sobic010G126800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G066200--Sobic005G066366 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic005G066200--Sobic004G008300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic005G066500 Sobic005G066200--Sobic002G019000 Sobic005G066200--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic002G019000--Sobic005G182900 Sobic002G019000--Sobic005G065700 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic002G019000--Sobic008G033100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic002G019000--Sobic010G213600 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic010G242800 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic002G019000--Sobic002G029500 Sobic002G019000--Sobic007G064900 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic002G019000--Sobic003G161400 Sobic010G126800--Sobic007G119750 Sobic010G126800--Sobic005G066200 Sobic010G126800--Sobic009G004950 Sobic010G126800--Sobic002G019000 Sobic010G126800--Sobic003G161400 Sobic010G126800--Sobic010G242800 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic010G126800--Sobic002G063700 Sobic010G126800--Sobic005G197350 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic010G126800--Sobic008G105800 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic007G064900--Sobic002G029500 Sobic007G064900--Sobic010G242800 Sobic007G064900--Sobic008G033100 Sobic007G064900--Sobic005G097900 Sobic007G064900--Sobic005G182900 Sobic007G064900--Sobic005G110511 Sobic007G064900--Sobic002G019000 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic007G064900--Sobic001G415100 Sobic007G064900--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100
Octagon: transcription factors


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