Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G066200.1
Synonym Sb05g005590
Functional annotation glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
UniProt C5Y6K1
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31640.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012780 , Zm00025a012777 , Zm00025a012766 , Zm00025a012769 , Zm00025a012779
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G119750 - -
2 Sobic.005G197350 - -
3 Sobic.010G126800 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
4 Sobic.005G066366 - -
5 Sobic.004G008300 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
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9 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
10 Sobic.009G177000 transmembrane protein 56, putative, expressed -
11 Sobic.002G258900 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@auxin responsive protein, putative, expressed K14488: SAUR family protein
12 Sobic.002G081850 - -
13 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
14 Sobic.003G204300 expressed protein -
15 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
16 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.005G110511 - -
18 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
20 Sobic.005G131200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G066200--Sobic007G119750 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066200--Sobic005G197350 Sobic010G126800 Sobic010G126800 Sobic005G066200--Sobic010G126800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G066200--Sobic005G066366 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic005G066200--Sobic004G008300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic009G004950 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066200--Sobic005G066500 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066200--Sobic002G019000 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G066200--Sobic010G242800 Sobic007G119750--Sobic005G066200 Sobic007G119750--Sobic005G197350 Sobic007G119750--Sobic005G066500 Sobic007G119750--Sobic002G019000 Sobic007G119750--Sobic010G126800 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic007G119750--Sobic005G065700 Sobic007G119750--Sobic010G242800 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic007G119750--Sobic007G064900 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic007G119750--Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic010G126800--Sobic007G119750 Sobic010G126800--Sobic005G066200 Sobic010G126800--Sobic009G004950 Sobic010G126800--Sobic002G019000 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G126800--Sobic003G161400 Sobic010G126800--Sobic010G242800 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic010G126800--Sobic002G063700 Sobic010G126800--Sobic005G197350 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic010G126800--Sobic008G105800 Sobic005G066366--Sobic010G242800 Sobic005G066366--Sobic005G110511 Sobic005G066366--Sobic005G197350 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G066366--Sobic005G197400 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G066366--Sobic008G033100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic005G066366--Sobic005G197500 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G182900 Sobic005G066366--Sobic005G066500 Sobic005G066366--Sobic003G161400 Sobic003G204300 Sobic003G204300 Sobic004G008300--Sobic003G204300 Sobic004G008300--Sobic005G066200 Sobic004G008300--Sobic009G004950 Sobic003G204400 Sobic003G204400 Sobic004G008300--Sobic003G204400 Sobic009G076300 Sobic009G076300 Sobic004G008300--Sobic009G076300 Sobic004G008300--Sobic010G126800 Sobic009G177000 Sobic009G177000 Sobic004G008300--Sobic009G177000 Sobic010G117500 Sobic010G117500 Sobic004G008300--Sobic010G117500 Sobic004G008300--Sobic007G119750 Sobic009G004950--Sobic010G126800 Sobic009G004950--Sobic003G204300 Sobic009G004950--Sobic005G066200 Sobic002G409200 Sobic002G409200 Sobic009G004950--Sobic002G409200 Sobic009G004950--Sobic004G008300 Sobic009G004950--Sobic007G119750 Sobic009G004950--Sobic002G063700 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic009G004950--Sobic005G069332 Sobic009G004950--Sobic008G105800 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic002G019000--Sobic005G182900 Sobic002G019000--Sobic005G065700 Sobic002G019000--Sobic008G033100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic002G019000--Sobic010G213600 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic010G242800 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic002G019000--Sobic002G029500 Sobic002G019000--Sobic007G064900 Sobic002G019000--Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic002G029500
Octagon: transcription factors


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