Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G131200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS62
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G035700 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
2 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G229100 receptor-like kinase, putative, expressed -
4 Sobic.005G197350 - -
5 Sobic.010G096700 leaf senescence related protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G066200 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.001G506700 exostosin family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G411000 AP2 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G506600 exostosin family domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G117500 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G391900 peroxidase precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G360500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.001G503000 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G081850 - -
15 Sobic.010G274400 reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G287200 WRKY23, expressed -
17 Sobic.006G180300 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
18 Sobic.005G177400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
19 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G131200 Sobic005G131200 Sobic008G035700 Sobic008G035700 Sobic005G131200--Sobic008G035700 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G131200--Sobic005G066300 Sobic006G229100 Sobic006G229100 Sobic005G131200--Sobic006G229100 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G131200--Sobic005G197350 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic005G131200--Sobic010G096700 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic005G131200--Sobic005G066200 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic005G131200--Sobic001G506700 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G131200--Sobic002G411000 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic005G131200--Sobic001G506600 Sobic008G035700--Sobic010G096700 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic008G035700--Sobic006G117500 Sobic008G035700--Sobic001G506600 Sobic008G035700--Sobic005G131200 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic008G035700--Sobic006G205500 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic008G035700--Sobic010G274400 Sobic003G140200 Sobic003G140200 Sobic008G035700--Sobic003G140200 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic008G035700--Sobic001G503000 Sobic001G514700 Sobic001G514700 Sobic008G035700--Sobic001G514700 Sobic005G066300--Sobic002G411000 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G066300--Sobic004G312500 Sobic005G066300--Sobic001G506700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G066300--Sobic005G071900 Sobic005G066300--Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic005G197350 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic006G209000 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G066300--Sobic002G081850 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066300--Sobic005G066500 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic006G229100--Sobic007G090472 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic006G229100--Sobic010G082000 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic006G229100--Sobic005G115300 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic006G229100--Sobic001G360500 Sobic006G229100--Sobic001G503000 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic006G229100--Sobic003G287200 Sobic006G229100--Sobic010G096700 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic006G229100--Sobic006G135300 Sobic001G149400 Sobic001G149400 Sobic006G229100--Sobic001G149400 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066366 Sobic005G197350--Sobic005G066500 Sobic005G197350--Sobic005G066200 Sobic005G197350--Sobic002G081850 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G197350--Sobic005G110511 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic005G197350--Sobic007G119750 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G197350--Sobic002G019000 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G197350--Sobic010G242800 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G197350--Sobic005G065700 Sobic010G096700--Sobic001G506600 Sobic010G096700--Sobic001G503000 Sobic010G096700--Sobic006G209000 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic010G096700--Sobic004G322000 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic010G096700--Sobic003G215300 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic010G096700--Sobic005G104200 Sobic010G096700--Sobic005G066300 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic010G096700--Sobic001G274400 Sobic010G096700--Sobic005G115300 Sobic005G066200--Sobic007G119750 Sobic005G066200--Sobic005G197350 Sobic010G126800 Sobic010G126800 Sobic005G066200--Sobic010G126800 Sobic005G066200--Sobic005G066366 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic005G066200--Sobic004G008300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic009G004950 Sobic005G066200--Sobic005G066500 Sobic005G066200--Sobic002G019000 Sobic005G066200--Sobic010G242800 Sobic001G506700--Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic005G065700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic005G071900 Sobic001G506700--Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic006G209000 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic005G066300 Sobic001G506700--Sobic001G503000 Sobic002G411000--Sobic005G066300 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic002G411000--Sobic006G108300 Sobic002G411000--Sobic004G312500 Sobic002G411000--Sobic005G071900 Sobic002G411000--Sobic006G009700 Sobic002G411000--Sobic005G066500 Sobic002G411000--Sobic001G506700 Sobic002G411000--Sobic001G506600 Sobic002G411000--Sobic010G274400 Sobic001G506600--Sobic010G096700 Sobic001G506600--Sobic001G503000 Sobic001G506600--Sobic005G104200 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic001G506600--Sobic002G029600 Sobic001G506600--Sobic002G411000 Sobic001G506600--Sobic002G019100 Sobic001G506600--Sobic004G322000 Sobic001G506600--Sobic006G209000 Sobic001G506600--Sobic003G215300
Octagon: transcription factors


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