Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G180300.2
Synonym Sb06g025490
Functional annotation ethylene-responsive protein related, putative, expressed
UniProt A0A1Z5REH0
Pfam -
Panther DB PTHR16223 PTHR16223:SF48
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G31050 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g47810.1 : ethylene-responsive protein related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056797
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
4 Sobic.002G391900 peroxidase precursor, putative, expressed -
5 Sobic.001G506700 exostosin family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G209000 Protein transferase (Os)(PubMedID : 27208977)@transferase family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G274400 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.006G031100 CAP (Cysteine-rich secretory proteins("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@SCP-like extracellular protein, expressed -
9 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
10 Sobic.005G182800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G193500 expressed protein -
12 Sobic.002G029600 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed K00088: IMPDH, IMP dehydrogenase
13 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
14 Sobic.003G382200 methyltransferase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G106100 GCRP9 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed -
16 Sobic.010G152500 glycosyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.003G255600 expressed protein -
18 Sobic.004G014600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
19 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
20 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G180300 Sobic006G180300 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic006G180300--Sobic005G065700 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic006G180300--Sobic005G182900 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic006G180300--Sobic002G019000 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic006G180300--Sobic002G391900 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic006G180300--Sobic001G506700 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic006G180300--Sobic006G209000 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic006G180300--Sobic001G274400 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic006G180300--Sobic006G031100 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic006G180300--Sobic005G071900 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic005G182900--Sobic008G033100 Sobic005G182900--Sobic002G019000 Sobic005G182900--Sobic010G242800 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G182900--Sobic002G029500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic005G182900--Sobic001G415100 Sobic005G182900--Sobic005G065700 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic005G182800 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic005G182900--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic005G182900--Sobic001G293100 Sobic002G019000--Sobic005G182900 Sobic002G019000--Sobic005G065700 Sobic002G019000--Sobic008G033100 Sobic002G019000--Sobic010G213600 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic009G165100 Sobic002G019000--Sobic010G242800 Sobic002G019000--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic002G019000--Sobic007G064900 Sobic002G019000--Sobic003G161400 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic002G391900--Sobic003G382200 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic002G391900--Sobic010G152500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic002G391900--Sobic004G009200 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic002G391900--Sobic009G106100 Sobic005G069500 Sobic005G069500 Sobic002G391900--Sobic005G069500 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic002G391900--Sobic006G097900 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic002G391900--Sobic005G216600 Sobic002G391900--Sobic006G031100 Sobic006G224500 Sobic006G224500 Sobic002G391900--Sobic006G224500 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic005G065700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic005G071900 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic006G209000 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic006G009700 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic001G506700--Sobic005G066300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic001G506700--Sobic001G503000 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic006G209000--Sobic007G154100 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic006G209000--Sobic006G108300 Sobic006G209000--Sobic005G071900 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic006G209000--Sobic004G312500 Sobic006G209000--Sobic001G503000 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic006G209000--Sobic002G029600 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic006G209000--Sobic010G096700 Sobic006G209000--Sobic001G506600 Sobic006G209000--Sobic009G106100 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic001G274400--Sobic004G014600 Sobic001G274400--Sobic009G165100 Sobic001G274400--Sobic010G152500 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic001G274400--Sobic004G322000 Sobic001G274400--Sobic003G382200 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic001G274400--Sobic007G090600 Sobic001G274400--Sobic002G029600 Sobic001G274400--Sobic006G031100 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic001G274400--Sobic006G135300 Sobic006G031100--Sobic007G090600 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic006G031100--Sobic003G215300 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic006G031100--Sobic006G196400 Sobic006G031100--Sobic002G029600 Sobic006G031100--Sobic004G014600 Sobic006G031100--Sobic005G182800 Sobic006G085700 Sobic006G085700 Sobic006G031100--Sobic006G085700 Sobic006G031100--Sobic004G322000 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic006G031100--Sobic006G205700 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic005G071900--Sobic002G029600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.