Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G124133.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSL6
Pfam PF12937 PF08268
Panther DB PTHR31790 PTHR31790:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07870 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g27570.1 : OsFBA3 - F-box and FBA domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G112200 - -
2 Sobic.010G124100 - -
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12 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G097600 - -
14 Sobic.003G129700 - -
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16 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
17 Sobic.004G223700 - -
18 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
19 Sobic.003G028700 - -
20 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4


Gene co-expression network
sample Sobic010G124133 Sobic010G124133 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic010G124133--Sobic002G112200 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G124133--Sobic010G124100 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G124133--Sobic007G045750 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic010G124133--Sobic002G062400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic010G124133--Sobic001G401750 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic010G124133--Sobic007G167600 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic010G124133--Sobic005G119400 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G124133--Sobic001G050650 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic010G124133--Sobic009G095720 Sobic002G112200--Sobic001G401750 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G112200--Sobic004G223700 Sobic002G112200--Sobic001G050650 SobicK031300 SobicK031300 Sobic002G112200--SobicK031300 Sobic002G112200--Sobic009G095720 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic002G112200--Sobic003G168600 SobicK043600 SobicK043600 Sobic002G112200--SobicK043600 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G112200--Sobic001G081450 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic002G112200--Sobic006G264400 Sobic010G124100--Sobic002G112200 Sobic010G124100--Sobic001G401750 Sobic010G124100--Sobic005G119400 Sobic010G124100--SobicK043600 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic001G050650 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic010G124100--Sobic010G167700 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic010G124100--Sobic003G301050 Sobic010G124100--Sobic003G168600 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic002G112200 Sobic002G062400--Sobic003G129700 Sobic002G062400--Sobic007G045750 Sobic002G062400--Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic009G158150 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic009G035000 Sobic002G062400--Sobic006G009200 Sobic002G062400--Sobic001G050650 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic002G062400--Sobic005G168900 Sobic001G401750--Sobic002G112200 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G223700 Sobic001G401750--Sobic009G095720 Sobic001G401750--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic001G081450 Sobic001G401750--Sobic006G264400 Sobic001G401750--SobicK031300 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G167600--Sobic009G145200 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic007G167600--Sobic003G028700 Sobic007G167600--Sobic001G401750 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic007G167600--Sobic004G072300 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G167600--Sobic004G249950 Sobic007G167600--Sobic007G098050 Sobic007G167600--Sobic001G081450 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G167600--Sobic002G112500 Sobic007G167600--Sobic004G223700 Sobic005G119400--Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic007G045750 Sobic005G119400--Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic009G025750 Sobic005G119400--Sobic001G401750 Sobic005G119400--Sobic009G035000 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic002G062400 Sobic005G119400--Sobic010G124100 Sobic001G050650--Sobic007G045750 Sobic001G050650--Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic009G025750 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G050650--Sobic002G073000 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic001G050650--Sobic010G166201 SobicK032500 SobicK032500 Sobic001G050650--SobicK032500 Sobic001G050650--Sobic005G119400 Sobic001G050650--Sobic002G062400 Sobic001G050650--Sobic004G223700 Sobic009G095720--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic003G168600 Sobic009G095720--Sobic007G098050 Sobic009G095720--SobicK031300 SobicK032400 SobicK032400 Sobic009G095720--SobicK032400 SobicK032600 SobicK032600 Sobic009G095720--SobicK032600 SobicK032350 SobicK032350 Sobic009G095720--SobicK032350 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic004G206000 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic009G095720--Sobic005G173100
Octagon: transcription factors


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