Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G195800.1
Synonym Sb10g024520,
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
Cinnamoyl-CoA reductase family (At) (PubMedID : 27208977)
reductase, putative, expressed
UniProt A0A194YKB3
Pfam PF01370
Panther DB PTHR10366 PTHR10366:SF354
NCBI CDD KOG1502; Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33590 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g41810.1 : reductase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051506 , Zm00025a051507 , Zm00025a051504 , Zm00025a032824
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7A02G396300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G162200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.001G266600 LTPL37 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
3 Sobic.009G048600 - -
4 Sobic.008G008200 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G087300 3-oxoacyl-reductase, chloroplast precursor, putative, expressed K00059: fabG, 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase
6 Sobic.007G068700 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
7 Sobic.004G167000 POEI29 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.009G239800 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G110538 - K08818: cell division cycle 2-like
10 Sobic.010G180000 - -
11 Sobic.001G266900 LTPL37 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.006G005700 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
13 Sobic.005G006000 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G332300 expressed protein -
15 Sobic.001G303750 - -
16 Sobic.003G098100 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
17 Sobic.008G156100 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
18 Sobic.002G028201 - K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.006G281132 - -
20 Sobic.008G126000 calmodulin binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G195800 Sobic010G195800 Sobic007G162200 Sobic007G162200 Sobic010G195800--Sobic007G162200 Sobic001G266600 Sobic001G266600 Sobic010G195800--Sobic001G266600 Sobic009G048600 Sobic009G048600 Sobic010G195800--Sobic009G048600 Sobic008G008200 Sobic008G008200 Sobic010G195800--Sobic008G008200 Sobic008G087300 Sobic008G087300 Sobic010G195800--Sobic008G087300 Sobic007G068700 Sobic007G068700 Sobic010G195800--Sobic007G068700 Sobic004G167000 Sobic004G167000 Sobic010G195800--Sobic004G167000 Sobic009G239800 Sobic009G239800 Sobic010G195800--Sobic009G239800 Sobic005G110538 Sobic005G110538 Sobic010G195800--Sobic005G110538 Sobic007G162200--Sobic001G266600 Sobic007G162200--Sobic010G195800 Sobic007G162200--Sobic009G048600 Sobic007G162200--Sobic008G087300 Sobic005G006000 Sobic005G006000 Sobic007G162200--Sobic005G006000 Sobic006G005700 Sobic006G005700 Sobic007G162200--Sobic006G005700 Sobic007G162200--Sobic008G008200 Sobic007G162200--Sobic004G167000 Sobic007G162200--Sobic009G239800 Sobic001G266600--Sobic009G048600 Sobic001G266600--Sobic007G162200 Sobic001G266600--Sobic005G006000 Sobic001G266600--Sobic010G195800 Sobic001G266600--Sobic006G005700 Sobic008G156100 Sobic008G156100 Sobic001G266600--Sobic008G156100 Sobic002G028201 Sobic002G028201 Sobic001G266600--Sobic002G028201 Sobic006G281132 Sobic006G281132 Sobic001G266600--Sobic006G281132 Sobic009G146000 Sobic009G146000 Sobic001G266600--Sobic009G146000 Sobic009G048600--Sobic001G266600 Sobic009G048600--Sobic005G006000 Sobic009G048600--Sobic008G156100 Sobic009G048600--Sobic002G028201 Sobic009G048600--Sobic006G281132 Sobic009G048600--Sobic006G005700 Sobic009G048600--Sobic007G162200 Sobic009G048600--Sobic009G146000 Sobic009G048600--Sobic010G195800 Sobic008G008200--Sobic008G087300 Sobic008G008200--Sobic004G167000 Sobic010G180000 Sobic010G180000 Sobic008G008200--Sobic010G180000 Sobic001G266900 Sobic001G266900 Sobic008G008200--Sobic001G266900 Sobic008G008200--Sobic009G239800 Sobic008G008200--Sobic007G068700 Sobic008G138300 Sobic008G138300 Sobic008G008200--Sobic008G138300 Sobic003G162500 Sobic003G162500 Sobic008G008200--Sobic003G162500 Sobic010G159500 Sobic010G159500 Sobic008G008200--Sobic010G159500 Sobic008G087300--Sobic004G167000 Sobic008G087300--Sobic001G266900 Sobic008G087300--Sobic008G008200 Sobic008G087300--Sobic010G180000 Sobic008G087300--Sobic008G138300 Sobic008G087300--Sobic010G159500 Sobic008G087300--Sobic009G239800 Sobic003G239400 Sobic003G239400 Sobic008G087300--Sobic003G239400 Sobic008G126000 Sobic008G126000 Sobic008G087300--Sobic008G126000 Sobic007G068700--Sobic008G008200 Sobic007G068700--Sobic010G180000 Sobic007G068700--Sobic009G239800 Sobic002G305400 Sobic002G305400 Sobic007G068700--Sobic002G305400 Sobic009G087900 Sobic009G087900 Sobic007G068700--Sobic009G087900 Sobic007G068700--Sobic004G167000 Sobic003G206100 Sobic003G206100 Sobic007G068700--Sobic003G206100 Sobic007G068700--Sobic008G087300 Sobic001G153800 Sobic001G153800 Sobic007G068700--Sobic001G153800 Sobic004G167000--Sobic008G087300 Sobic004G167000--Sobic001G266900 Sobic004G167000--Sobic008G008200 Sobic004G167000--Sobic010G180000 Sobic004G167000--Sobic008G138300 Sobic004G167000--Sobic010G159500 Sobic007G064600 Sobic007G064600 Sobic004G167000--Sobic007G064600 Sobic004G167000--Sobic003G239400 Sobic003G040400 Sobic003G040400 Sobic004G167000--Sobic003G040400 Sobic009G239800--Sobic008G008200 Sobic009G239800--Sobic008G087300 Sobic009G239800--Sobic004G167000 Sobic001G303750 Sobic001G303750 Sobic009G239800--Sobic001G303750 Sobic009G239800--Sobic010G180000 Sobic009G239800--Sobic001G266900 Sobic009G239800--Sobic007G068700 Sobic010G108100 Sobic010G108100 Sobic009G239800--Sobic010G108100 Sobic009G239800--Sobic008G138300 Sobic005G110538--Sobic008G087300 Sobic005G110538--Sobic008G008200 Sobic005G110538--Sobic004G167000 Sobic005G110538--Sobic001G266900 Sobic005G110538--Sobic010G180000 Sobic005G110538--Sobic008G138300 Sobic005G110538--Sobic007G068700 Sobic005G110538--Sobic009G239800 Sobic005G110538--Sobic003G162500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.