Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K020400.1
Synonym Sb0199s002010
Functional annotation 60S ribosomal protein L7, putative, expressed
UniProt C6JSA6
Pfam -
Panther DB PTHR11524
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02937; RP-L7e, large subunit ribosomal protein L7e
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44120 : Ribosomal protein L30/L7 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51630.1 : 60S ribosomal protein L7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030905 , Zm00025a054952 , Zm00025a056964 , Zm00025a009889
Brachypodium KQJ84442
Barley -
Wheat TraesCS5D02G462800 , TraesCS5A02G452400 , TraesCS2B02G453900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.001G209701 - -
20 Sobic.001G209701 - -


Gene co-expression network
sample SobicK020400 SobicK020400 Sobic002G027100 Sobic002G027100 SobicK020400--Sobic002G027100 Sobic007G047050 Sobic007G047050 SobicK020400--Sobic007G047050 Sobic006G021500 Sobic006G021500 SobicK020400--Sobic006G021500 Sobic001G495500 Sobic001G495500 SobicK020400--Sobic001G495500 Sobic003G015950 Sobic003G015950 SobicK020400--Sobic003G015950 Sobic009G125200 Sobic009G125200 SobicK020400--Sobic009G125200 Sobic005G151400 Sobic005G151400 SobicK020400--Sobic005G151400 Sobic010G029500 Sobic010G029500 SobicK020400--Sobic010G029500 Sobic006G178900 Sobic006G178900 SobicK020400--Sobic006G178900 Sobic002G027100--Sobic007G047050 Sobic002G027100--Sobic009G125200 Sobic002G027100--Sobic006G021500 Sobic002G027100--SobicK020400 Sobic002G027100--Sobic005G151400 Sobic002G027100--Sobic006G178900 Sobic007G106200 Sobic007G106200 Sobic002G027100--Sobic007G106200 Sobic002G027100--Sobic001G495500 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic002G027100--Sobic002G096400 Sobic007G047050--Sobic002G027100 Sobic007G047050--Sobic009G125200 Sobic001G538000 Sobic001G538000 Sobic007G047050--Sobic001G538000 Sobic007G047050--SobicK020400 Sobic004G101200 Sobic004G101200 Sobic007G047050--Sobic004G101200 Sobic007G047050--Sobic001G495500 Sobic007G064100 Sobic007G064100 Sobic007G047050--Sobic007G064100 Sobic009G219500 Sobic009G219500 Sobic007G047050--Sobic009G219500 Sobic010G124600 Sobic010G124600 Sobic007G047050--Sobic010G124600 Sobic006G021500--Sobic007G106200 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic006G021500--Sobic001G209701 Sobic010G156100 Sobic010G156100 Sobic001G495500--Sobic010G156100 Sobic003G274000 Sobic003G274000 Sobic001G495500--Sobic003G274000 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic001G495500--Sobic006G227100 Sobic001G495500--Sobic009G125200 Sobic001G495500--Sobic005G151400 Sobic001G495500--Sobic002G027100 Sobic006G111100 Sobic006G111100 Sobic001G495500--Sobic006G111100 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic001G495500--Sobic006G131100 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic001G495500--Sobic005G179700 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic003G015950--Sobic005G190300 Sobic001G396600 Sobic001G396600 Sobic003G015950--Sobic001G396600 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic003G015950--Sobic010G121800 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic003G015950--Sobic008G143200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic003G015950--Sobic002G332000 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic003G015950--Sobic001G200800 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic003G015950--Sobic008G123350 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic003G015950--Sobic002G103000 Sobic010G029450 Sobic010G029450 Sobic003G015950--Sobic010G029450 Sobic009G125200--Sobic003G274000 Sobic009G125200--Sobic002G027100 Sobic003G443900 Sobic003G443900 Sobic009G125200--Sobic003G443900 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic009G125200--Sobic002G345500 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic009G125200--Sobic005G153300 Sobic002G053201 Sobic002G053201 Sobic009G125200--Sobic002G053201 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic009G125200--Sobic002G162200 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic009G125200--Sobic008G071200 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic009G125200--Sobic008G182200 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic005G151400--Sobic004G029500 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G151400--Sobic002G058100 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic005G151400--Sobic002G095000 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G151400--Sobic010G191400 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic005G151400--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G151400--Sobic005G081800 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G151400--Sobic005G027200 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G151400--Sobic006G006000 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic005G151400--Sobic001G349600 Sobic005G077700 Sobic005G077700 Sobic010G029500--Sobic005G077700 Sobic010G029500--Sobic001G209701 Sobic004G015200 Sobic004G015200 Sobic006G178900--Sobic004G015200 Sobic006G178900--Sobic007G106200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic006G178900--Sobic005G152400 Sobic005G071250 Sobic005G071250 Sobic006G178900--Sobic005G071250 Sobic006G178900--Sobic006G021500 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic006G178900--Sobic004G048500 Sobic006G178900--Sobic001G209701
Octagon: transcription factors


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