Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G068000.2,Sobic.001G068000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHM5 , A0A1Z5S4L1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G023400 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
2 Sobic.008G057800 methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
4 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
5 Sobic.007G221932 - -
6 Sobic.008G097800 CAMK_CAMK_like.47 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
7 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G323000 TBC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G145400 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
10 Sobic.008G099000 protein of unknown function domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G035200 - -
12 Sobic.009G091000 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.11 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
13 Sobic.001G539880 - -
14 Sobic.004G222400 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.010G034300 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
16 Sobic.003G195400 - -
17 Sobic.009G252000 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
18 Sobic.001G202900 expressed protein -
19 Sobic.001G351600 hydrolase protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G254100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G068000 Sobic001G068000 Sobic005G023400 Sobic005G023400 Sobic001G068000--Sobic005G023400 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic001G068000--Sobic008G057800 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic001G068000--Sobic004G024800 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic001G068000--Sobic008G011901 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic001G068000--Sobic007G221932 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic001G068000--Sobic008G097800 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic001G068000--Sobic007G080100 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic001G068000--Sobic002G323000 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic001G068000--Sobic002G145400 Sobic005G023400--Sobic007G221932 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic005G023400--Sobic005G035200 Sobic005G023400--Sobic008G097800 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic005G023400--Sobic009G091000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic005G023400--Sobic004G336401 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic005G023400--Sobic009G252000 Sobic005G023400--Sobic002G145400 Sobic005G023400--Sobic004G024800 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic005G023400--Sobic010G254100 Sobic008G057800--Sobic008G011901 Sobic008G057800--Sobic008G097800 Sobic008G057800--Sobic002G145400 Sobic008G057800--Sobic004G024800 Sobic008G057800--Sobic005G035200 Sobic008G057800--Sobic007G221932 Sobic008G057800--Sobic007G080100 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic008G057800--Sobic003G195400 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic008G057800--Sobic001G539880 Sobic004G024800--Sobic001G539880 Sobic004G024800--Sobic005G035200 Sobic004G024800--Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic008G011901 Sobic004G024800--Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic007G221932 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G024800--Sobic005G035250 Sobic008G011901--Sobic007G080100 Sobic008G011901--Sobic004G024800 Sobic008G011901--Sobic005G035200 Sobic008G011901--Sobic007G221932 Sobic008G011901--Sobic002G145400 Sobic008G011901--Sobic001G539880 Sobic008G011901--Sobic008G097800 Sobic008G011901--Sobic003G195400 Sobic008G011901--Sobic009G091000 Sobic007G221932--Sobic009G091000 Sobic007G221932--Sobic008G097800 Sobic007G221932--Sobic009G252000 Sobic007G221932--Sobic005G035200 Sobic007G221932--Sobic002G145400 Sobic007G221932--Sobic004G336401 Sobic007G221932--Sobic010G254100 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic007G221932--Sobic010G034300 Sobic007G221932--Sobic007G080100 Sobic008G097800--Sobic007G221932 Sobic008G097800--Sobic004G336401 Sobic008G097800--Sobic009G091000 Sobic008G097800--Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic010G254100 Sobic008G097800--Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic005G035200 Sobic008G097800--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic004G024800 Sobic007G080100--Sobic008G011901 Sobic007G080100--Sobic004G024800 Sobic007G080100--Sobic005G035200 Sobic007G080100--Sobic007G221932 Sobic007G080100--Sobic001G539880 Sobic007G080100--Sobic002G145400 Sobic007G080100--Sobic003G195400 Sobic007G080100--Sobic005G035250 Sobic007G080100--Sobic008G097800 Sobic002G323000--Sobic004G024800 Sobic002G323000--Sobic008G011901 Sobic002G323000--Sobic007G080100 Sobic002G323000--Sobic007G221932 Sobic002G323000--Sobic005G035200 Sobic002G323000--Sobic001G539880 Sobic002G323000--Sobic009G091000 Sobic002G323000--Sobic008G097800 Sobic002G323000--Sobic002G145400 Sobic002G145400--Sobic005G035200 Sobic002G145400--Sobic008G097800 Sobic002G145400--Sobic004G336401 Sobic002G145400--Sobic007G221932 Sobic002G145400--Sobic004G024800 Sobic002G145400--Sobic010G254100 Sobic002G145400--Sobic007G080100 Sobic002G145400--Sobic009G091000 Sobic002G145400--Sobic003G195400
Octagon: transcription factors


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