Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G104400.1
Synonym Sb01g009320
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WM00
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g51980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008004
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G002850 - -
2 Sobic.004G089700 - -
3 Sobic.006G075700 expressed protein -
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8 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
10 Sobic.008G023000 expressed protein -
11 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
12 Sobic.004G226300 expressed protein -
13 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
14 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G527400 - -
16 Sobic.004G347866 - -
17 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
18 Sobic.003G104900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
19 Sobic.002G173600 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G223700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G104400 Sobic001G104400 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic001G104400--Sobic010G002850 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G104400--Sobic004G089700 Sobic006G075700 Sobic006G075700 Sobic001G104400--Sobic006G075700 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic001G104400--Sobic005G209800 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic001G104400--Sobic002G048250 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G104400--Sobic001G483700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic001G104400--Sobic002G285525 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic001G104400--Sobic007G183000 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic001G104400--Sobic004G224300 Sobic010G002850--Sobic005G209800 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic010G002850--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic010G002850--Sobic008G002100 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic010G002850--Sobic004G226300 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic010G002850--Sobic001G527400 Sobic010G002850--Sobic007G183000 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic010G002850--Sobic006G171000 Sobic005G156700 Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G156700 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic010G002850--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic006G075700--Sobic001G494150 Sobic006G075700--Sobic005G156700 Sobic006G075700--Sobic010G002850 Sobic002G003100 Sobic002G003100 Sobic006G075700--Sobic002G003100 Sobic006G075700--Sobic005G209800 Sobic006G075700--Sobic004G089700 Sobic006G075700--Sobic002G048250 Sobic006G075700--Sobic007G183000 Sobic006G075700--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic001G483700--Sobic004G226300 Sobic001G483700--Sobic007G183000 Sobic001G483700--Sobic005G209800 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic002G285525 Sobic001G483700--Sobic001G527400 Sobic001G483700--Sobic008G002100 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic001G483700--Sobic003G104900 Sobic001G483700--Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic004G224300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800
Octagon: transcription factors


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