Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G075700.1
Synonym IDL2
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PKU0
Pfam -
Panther DB PTHR33599 PTHR33599:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G64667 : inflorescence deficient in abscission (IDA)-like 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT61055
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G494150 - -
2 Sobic.005G156700 laccase precursor protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G002850 - -
4 Sobic.002G003100 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
5 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
6 Sobic.004G089700 - -
7 Sobic.002G048250 - -
8 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
10 Sobic.004G226300 expressed protein -
11 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
12 Sobic.004G347866 - -
13 Sobic.008G023000 expressed protein -
14 Sobic.001G527400 - -
15 Sobic.001G483700 Cupin domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G157550 - -
17 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
19 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
20 Sobic.001G104400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G075700 Sobic006G075700 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic006G075700--Sobic001G494150 Sobic005G156700 Sobic005G156700 Sobic006G075700--Sobic005G156700 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G075700--Sobic010G002850 Sobic002G003100 Sobic002G003100 Sobic006G075700--Sobic002G003100 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G075700--Sobic005G209800 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic006G075700--Sobic004G089700 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic006G075700--Sobic002G048250 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic006G075700--Sobic007G183000 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G075700--Sobic006G171000 Sobic001G494150--Sobic006G075700 Sobic010G259200 Sobic010G259200 Sobic001G494150--Sobic010G259200 Sobic010G119600 Sobic010G119600 Sobic001G494150--Sobic010G119600 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic001G494150--Sobic009G236500 Sobic002G001300 Sobic002G001300 Sobic001G494150--Sobic002G001300 Sobic002G366700 Sobic002G366700 Sobic001G494150--Sobic002G366700 Sobic001G494150--Sobic010G002850 Sobic010G087200 Sobic010G087200 Sobic001G494150--Sobic010G087200 Sobic001G494150--Sobic005G156700 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic005G156700--Sobic008G002100 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic005G156700--Sobic008G023000 Sobic005G156700--Sobic005G209800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic005G156700--Sobic004G226300 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic005G156700--Sobic001G527400 Sobic005G156700--Sobic007G183000 Sobic005G156700--Sobic010G002850 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic005G156700--Sobic005G231800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic005G156700--Sobic003G173032 Sobic010G002850--Sobic005G209800 Sobic010G002850--Sobic008G023000 Sobic010G002850--Sobic008G002100 Sobic010G002850--Sobic004G226300 Sobic010G002850--Sobic001G527400 Sobic010G002850--Sobic007G183000 Sobic010G002850--Sobic006G171000 Sobic010G002850--Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G231800 Sobic002G003100--Sobic005G209800 Sobic002G003100--Sobic005G231800 Sobic002G003100--Sobic008G002100 Sobic002G003100--Sobic008G023000 Sobic002G003100--Sobic004G226300 Sobic002G003100--Sobic006G171000 Sobic002G003100--Sobic001G527400 Sobic002G003100--Sobic007G183000 Sobic002G003100--Sobic005G156700 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


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