Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G243300.2
Synonym CLH2, ATCLH2, Sb01g021520
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
chlorophyllase-2, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S7E4
Pfam PF12695
Panther DB PTHR33428 PTHR33428:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K08099; chlorophyllase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43860 : chlorophyllase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g28370.1 : chlorophyllase-2, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006890
Brachypodium KQJ96759
Barley -
Wheat TraesCS3A02G101900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G243300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G096150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G243300 Sobic001G243300 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic001G243300--Sobic003G082401 Sobic003G313700 Sobic003G313700 Sobic001G243300--Sobic003G313700 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic001G243300--Sobic001G434450 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic001G243300--Sobic001G212701 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic001G243300--Sobic004G314750 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic001G243300--Sobic002G076932 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic001G243300--Sobic002G326200 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G243300--Sobic007G157200 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G243300--Sobic009G144050 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic003G082401--Sobic010G150600 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic003G082401--Sobic009G184500 Sobic003G082401--Sobic001G243300 Sobic003G082401--Sobic009G144050 Sobic003G082401--Sobic003G313700 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic003G082401--Sobic001G490600 Sobic003G082401--Sobic001G212701 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic003G082401--Sobic008G096150 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic003G082401--Sobic005G155001 Sobic003G313700--Sobic004G314750 Sobic003G313700--Sobic002G326200 Sobic003G313700--Sobic001G434450 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G313700--Sobic008G164525 Sobic003G313700--Sobic001G212701 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic003G313700--Sobic003G101600 Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic003G313700--Sobic006G110600 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic003G313700--Sobic003G008850 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic003G313700--Sobic002G114600 Sobic001G434450--Sobic008G164525 Sobic001G434450--Sobic004G314750 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic001G434450--Sobic006G256801 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic001G434450--Sobic006G094400 Sobic001G434450--Sobic003G008850 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic001G434450--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G434450--Sobic010G244701 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G434450--Sobic001G120100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic001G434450--Sobic006G222800 Sobic001G212701--Sobic007G157200 Sobic001G212701--Sobic002G114600 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic001G212701--Sobic010G132300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G184500 Sobic001G212701--Sobic004G314750 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic001G212701--Sobic007G174100 Sobic001G212701--Sobic002G326200 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic001G212701--Sobic001G176800 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G212701--Sobic005G094500 Sobic004G314750--Sobic008G164525 Sobic004G314750--Sobic001G434450 Sobic004G314750--Sobic006G094400 Sobic004G314750--Sobic006G256801 Sobic004G314750--Sobic002G114600 Sobic004G314750--Sobic010G244701 Sobic004G314750--Sobic003G008850 Sobic004G314750--Sobic009G094000 Sobic004G314750--Sobic006G222800 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic005G094500 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic002G076932--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic002G076932--Sobic008G054400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic010G041500 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic004G184500 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic001G212701 Sobic002G326200--Sobic007G174100 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic010G200800 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G326200--Sobic005G076100 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic002G326200--Sobic003G149900 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic002G326200--Sobic006G058300 Sobic002G326200--Sobic003G008850 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic002G326200--Sobic010G257300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic002G326200--Sobic001G115900 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic002G326200--Sobic009G258150 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic001G212701 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic007G157200--Sobic003G279600 Sobic007G157200--Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic010G132300 Sobic007G157200--Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic009G184500 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G157200--Sobic002G018133 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic009G144050--Sobic004G288900 Sobic009G144050--Sobic002G018133 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic009G144050--Sobic001G487250 Sobic009G144050--Sobic003G082401 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic009G144050--Sobic001G400101 Sobic009G144050--Sobic009G184500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic009G144050--Sobic003G155350 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic009G144050--Sobic008G096300 Sobic009G144050--Sobic004G184500
Octagon: transcription factors


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