Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G250900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKV1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G522800 - -
2 Sobic.002G015200 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G307500 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G099700 Invertase genes(PubMedID : 24456189)@Sugar degradation(PubMedID : 27330561)@glycosyl hydrolases, putative, expressed K01193: INV, beta-fructofuranosidase
5 Sobic.001G272100 expressed protein -
6 Sobic.010G048966 - -
7 Sobic.004G351932 - -
8 Sobic.004G051500 OsMADS80 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
9 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
10 Sobic.002G087600 OsFBX231 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G042800 expressed protein -
12 Sobic.004G349500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G252850 - -
14 Sobic.001G005400 - -
15 Sobic.005G151000 protein kinase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G021000 exocyst complex component 6, putative, expressed -
17 Sobic.006G077700 - -
18 Sobic.008G165401 - -
19 Sobic.010G082300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
20 Sobic.006G066050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G250900 Sobic001G250900 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic001G250900--Sobic001G522800 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic001G250900--Sobic002G015200 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic001G250900--Sobic003G307500 Sobic001G099700 Sobic001G099700 Sobic001G250900--Sobic001G099700 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic001G250900--Sobic001G272100 Sobic010G048966 Sobic010G048966 Sobic001G250900--Sobic010G048966 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic001G250900--Sobic004G351932 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic001G250900--Sobic004G051500 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G250900--Sobic009G125100 Sobic001G522800--Sobic003G307500 Sobic001G522800--Sobic004G051500 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic001G522800--Sobic004G252850 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic001G522800--Sobic009G021000 Sobic001G522800--Sobic009G125100 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic001G522800--Sobic009G042800 Sobic001G522800--Sobic002G015200 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic001G522800--Sobic006G066050 Sobic001G522800--Sobic004G351932 Sobic002G015200--Sobic001G272100 Sobic002G015200--Sobic009G042800 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic002G015200--Sobic002G087600 Sobic002G015200--Sobic009G125100 Sobic002G015200--Sobic003G307500 Sobic002G015200--Sobic009G021000 Sobic002G015200--Sobic006G066050 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic002G015200--Sobic007G112832 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic002G015200--Sobic004G059200 Sobic003G307500--Sobic001G522800 Sobic003G307500--Sobic009G021000 Sobic003G307500--Sobic002G015200 Sobic003G307500--Sobic009G042800 Sobic003G307500--Sobic009G125100 Sobic003G307500--Sobic006G066050 Sobic003G307500--Sobic002G087600 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic003G307500--Sobic010G082300 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic003G307500--Sobic003G054800 Sobic008G165401 Sobic008G165401 Sobic001G099700--Sobic008G165401 Sobic001G099700--Sobic010G048966 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic001G099700--Sobic001G474100 Sobic001G099700--Sobic002G015200 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic001G099700--Sobic009G103650 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic001G099700--Sobic008G144701 Sobic001G110250 Sobic001G110250 Sobic001G099700--Sobic001G110250 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic001G099700--Sobic009G047900 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic001G099700--Sobic007G193600 Sobic001G272100--Sobic002G015200 Sobic001G272100--Sobic009G125100 Sobic001G272100--Sobic007G112832 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic001G272100--Sobic007G209900 Sobic001G272100--Sobic004G059200 Sobic001G272100--Sobic009G042800 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic001G272100--Sobic003G066300 Sobic001G272100--Sobic002G087600 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic001G272100--Sobic001G538425 Sobic010G048966--Sobic001G099700 Sobic010G048966--Sobic008G165401 Sobic010G048966--Sobic009G042800 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic010G048966--Sobic004G250800 Sobic010G048966--Sobic002G015200 Sobic010G048966--Sobic009G103650 Sobic010G048966--Sobic001G474100 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic010G048966--Sobic010G010201 Sobic010G048966--Sobic009G125100 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic004G351932--Sobic004G349500 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic004G351932--Sobic009G096566 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic004G351932--Sobic001G005400 Sobic004G351932--Sobic001G522800 Sobic004G351932--Sobic004G051500 Sobic004G351932--Sobic004G252850 Sobic004G351932--Sobic003G307500 Sobic004G351932--Sobic010G082300 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic004G351932--Sobic004G251701 Sobic004G051500--Sobic001G522800 Sobic004G051500--Sobic004G252850 Sobic004G051500--Sobic003G307500 Sobic004G051500--Sobic004G349500 Sobic004G051500--Sobic004G351932 Sobic004G051500--Sobic001G005400 Sobic004G051500--Sobic009G021000 Sobic004G051500--Sobic006G066050 Sobic004G051500--Sobic010G082300 Sobic009G125100--Sobic009G042800 Sobic009G125100--Sobic004G059200 Sobic009G125100--Sobic009G021000 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic006G066050 Sobic009G125100--Sobic002G087600 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic009G125100--Sobic007G161100 Sobic009G125100--Sobic001G272100 Sobic009G125100--Sobic002G015200
Octagon: transcription factors


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