Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G099700.1
Synonym AtcwINV2, INV1;INV1, CWINV2, Sb01g008910
Functional annotation Invertase genes (PubMedID : 24456189)
Sugar degradation (PubMedID : 27330561)
glycosyl hydrolases, putative, expressed
UniProt C5WLV6
Pfam PF08244 PF00251
Panther DB PTHR31953 PTHR31953:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01193; INV, beta-fructofuranosidase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G52600 : cell wall invertase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33720.1 : glycosyl hydrolases, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020547 , Zm00025a056002 , Zm00025a056001 , Zm00025a011504 , Zm00025a009413 , Zm00025a025860
Brachypodium PNT73659 , KQK13342 , KQJ82525 , KQJ82524 , KQK11711
Barley HORVU2Hr1G073210.8 , HORVU2Hr1G073210.6 , HORVU2Hr1G073210.1 , HORVU4Hr1G086300.9 , HORVU4Hr1G086300.7 , HORVU4Hr1G086300.5 , HORVU4Hr1G086300.4 , HORVU4Hr1G086300.3 , HORVU4Hr1G086300.2 , HORVU4Hr1G086300.1 , HORVU4Hr1G086300.8 , HORVU4Hr1G086300.14 , HORVU4Hr1G086300.13 , HORVU4Hr1G086300.12 , HORVU4Hr1G086300.11 , HORVU4Hr1G086300.10 , HORVU4Hr1G011000.1 , HORVU2Hr1G073210.7 , HORVU2Hr1G073210.5 , HORVU2Hr1G073210.4 , HORVU2Hr1G073210.3 , HORVU2Hr1G073210.2
Wheat TraesCS4A02G321600 , TraesCS3B02G028100 , TraesCS5B02G557400 , TraesCS4D02G065000 , TraesCS2D02G489200 , TraesCS2D02G489200 , TraesCS4B02G356800 , TraesCS2A02G295400 , TraesCS4A02G321400 , TraesCS4D02G350500 , TraesCS4B02G066000 , TraesCS4A02G248700 , TraesCS5A02G526200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G165401 - -
2 Sobic.010G048966 - -
3 Sobic.001G474100 pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
9 Sobic.007G193600 - -
10 Sobic.001G194800 TATA-binding protein, putative, expressed K03120: TBP, transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
11 Sobic.004G256100 transporter-related, putative, expressed -
12 Sobic.001G272100 expressed protein -
13 Sobic.002G364700 ZOS7-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
14 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
15 Sobic.006G115700 WRKY35, expressed K18835: WRKY transcription factor 2
16 Sobic.005G176700 methyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.001G538425 - -
18 Sobic.009G042800 expressed protein -
19 Sobic.008G055200 dirigent, putative, expressed -
20 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase


Gene co-expression network
sample Sobic001G099700 Sobic001G099700 Sobic008G165401 Sobic008G165401 Sobic001G099700--Sobic008G165401 Sobic010G048966 Sobic010G048966 Sobic001G099700--Sobic010G048966 Sobic001G474100 Sobic001G474100 Sobic001G099700--Sobic001G474100 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic001G099700--Sobic002G015200 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic001G099700--Sobic009G103650 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic001G099700--Sobic008G144701 Sobic001G110250 Sobic001G110250 Sobic001G099700--Sobic001G110250 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic001G099700--Sobic009G047900 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic001G099700--Sobic007G193600 Sobic008G165401--Sobic009G103650 Sobic008G165401--Sobic001G099700 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic008G165401--Sobic007G142801 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G165401--Sobic005G176700 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic008G165401--Sobic004G327000 Sobic004G095100 Sobic004G095100 Sobic008G165401--Sobic004G095100 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic008G165401--Sobic003G297100 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic008G165401--Sobic009G060000 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic008G165401--Sobic009G244100 Sobic010G048966--Sobic001G099700 Sobic010G048966--Sobic008G165401 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic010G048966--Sobic009G042800 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic010G048966--Sobic004G250800 Sobic010G048966--Sobic002G015200 Sobic010G048966--Sobic009G103650 Sobic010G048966--Sobic001G474100 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic010G048966--Sobic010G010201 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic010G048966--Sobic009G125100 Sobic001G474100--Sobic009G047900 Sobic001G474100--Sobic007G193600 Sobic004G256100 Sobic004G256100 Sobic001G474100--Sobic004G256100 Sobic001G474100--Sobic008G144701 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic001G474100--Sobic010G196700 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic001G474100--Sobic001G518900 Sobic001G103600 Sobic001G103600 Sobic001G474100--Sobic001G103600 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic001G474100--Sobic008G095500 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic001G474100--Sobic005G058200 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic002G015200--Sobic001G272100 Sobic002G015200--Sobic009G042800 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic002G015200--Sobic002G087600 Sobic002G015200--Sobic009G125100 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic002G015200--Sobic003G307500 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic002G015200--Sobic009G021000 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic002G015200--Sobic006G066050 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic002G015200--Sobic007G112832 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic002G015200--Sobic004G059200 Sobic009G103650--Sobic009G060000 Sobic001G053500 Sobic001G053500 Sobic009G103650--Sobic001G053500 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic009G103650--Sobic004G308800 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic009G103650--Sobic002G049700 Sobic009G103650--Sobic009G244100 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G103650--Sobic001G409000 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic009G103650--Sobic001G392650 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic009G103650--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic009G103650--Sobic002G406801 Sobic008G144701--Sobic009G047900 Sobic008G144701--Sobic010G196700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic002G307400 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G144701--Sobic004G086900 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic008G144701--Sobic007G082300 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G144701--Sobic007G110800 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic008G144701--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic008G144701--Sobic007G167950 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic008G144701--Sobic001G253750 Sobic001G110250--Sobic001G474100 Sobic001G110250--Sobic008G144701 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic001G110250--Sobic001G194800 Sobic001G110250--Sobic005G176700 Sobic001G110250--Sobic009G047900 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic001G110250--Sobic008G055200 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic001G110250--Sobic005G000900 Sobic001G110250--Sobic007G142801 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic001G110250--Sobic007G198900 Sobic009G047900--Sobic010G196700 Sobic009G047900--Sobic005G058200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic009G047900--Sobic005G007200 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic009G047900--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic007G082300 Sobic009G047900--Sobic001G518900 Sobic009G047900--Sobic004G086900 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic009G047900--Sobic008G168500 Sobic007G193600--Sobic001G474100 Sobic007G193600--Sobic009G047900 Sobic007G193600--Sobic004G256100 Sobic007G193600--Sobic001G518900 Sobic007G193600--Sobic008G144701 Sobic007G193600--Sobic010G196700 Sobic007G193600--Sobic001G103600 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic007G193600--Sobic010G202400 Sobic008G155000 Sobic008G155000 Sobic007G193600--Sobic008G155000
Octagon: transcription factors


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