Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G257400.2,Sobic.001G257400.1
Synonym Sb01g023120
Functional annotation mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S7F4 , C5WN55
Pfam PF03637
Panther DB PTHR22599 PTHR22599:SF26
NCBI CDD KOG0440; Cell cycle-associated protein Mob1-1
KEGG Orthology K06685; MOB1, MOB kinase activator 1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45550 : Mob1/phocein family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g25674.1,LOC_Os10g25674.2 : mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017845
Brachypodium PNT67359 , PNT67360
Barley -
Wheat TraesCS1D02G133400 , TraesCS1D02G133500 , TraesCS1A02G138700
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G080700 CAMK_CAMK_like.46 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
3 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
4 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
5 Sobic.002G236800 - -
6 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
7 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G166001 - -
10 Sobic.004G078750 - -
11 Sobic.002G100766 - -
12 Sobic.006G037100 expressed protein -
13 Sobic.004G163900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25
14 Sobic.008G131300 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
15 Sobic.003G322000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G129800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G098900 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
18 Sobic.003G379100 expressed protein -
19 Sobic.001G433500 expressed protein -
20 Sobic.001G249100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G257400 Sobic001G257400 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic001G257400--Sobic002G305800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic001G257400--Sobic008G080700 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic001G257400--Sobic004G080600 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic001G257400--Sobic006G251100 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic001G257400--Sobic002G236800 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic001G257400--Sobic007G051200 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic001G257400--Sobic002G122500 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic001G257400--Sobic003G226400 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic001G257400--Sobic003G166001 Sobic002G305800--Sobic008G080700 Sobic002G305800--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic004G080600 Sobic002G305800--Sobic006G251100 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic007G051200 Sobic002G305800--Sobic002G236800 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G305800--Sobic008G131300 Sobic002G305800--Sobic003G166001 Sobic008G080700--Sobic002G305800 Sobic008G080700--Sobic003G166001 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic002G122500 Sobic008G080700--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic008G131300 Sobic008G080700--Sobic004G163900 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic008G080700--Sobic006G098900 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic008G080700--Sobic003G400700 Sobic004G080600--Sobic002G305800 Sobic004G080600--Sobic008G080700 Sobic004G080600--Sobic006G251100 Sobic004G080600--Sobic002G236800 Sobic004G080600--Sobic003G226400 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic004G080600--Sobic004G078750 Sobic004G080600--Sobic007G051200 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic004G080600--Sobic002G100766 Sobic004G080600--Sobic002G122500 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic006G251100--Sobic003G379100 Sobic002G236800--Sobic004G078750 Sobic002G236800--Sobic002G100766 Sobic002G236800--Sobic003G226400 Sobic002G236800--Sobic003G379100 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G236800--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G236800--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G236800--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G122500 Sobic002G122500--Sobic004G163900 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic002G122500--Sobic003G322000 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G122500--Sobic008G129800 Sobic002G122500--Sobic002G305800 Sobic002G122500--Sobic008G080700 Sobic002G122500--Sobic008G131300 Sobic002G122500--Sobic006G037100 Sobic002G122500--Sobic004G080600 Sobic002G122500--Sobic007G051200 Sobic003G226400--Sobic004G078750 Sobic003G226400--Sobic002G100766 Sobic003G226400--Sobic002G236800 Sobic003G226400--Sobic003G379100 Sobic003G226400--Sobic008G190300 Sobic003G226400--Sobic009G089800 Sobic003G226400--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G006700 Sobic003G166001--Sobic006G037100 Sobic003G166001--Sobic008G080700 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic003G166001--Sobic001G433500 Sobic003G166001--Sobic003G400700 Sobic003G166001--Sobic006G098900 Sobic003G166001--Sobic002G305800 Sobic003G166001--Sobic008G131300 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic003G166001--Sobic005G098100 Sobic003G166001--Sobic007G051200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.