Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G305100.1
Synonym
Functional annotation pectinacetylesterase domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QM07
Pfam PF03283
Panther DB PTHR21562
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G23870 : Pectinacetylesterase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g44070.1 : pectinacetylesterase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052014
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G053400.24 , HORVU1Hr1G053400.25 , HORVU1Hr1G053400.28 , HORVU1Hr1G053400.29 , HORVU1Hr1G053400.57 , HORVU1Hr1G053400.55 , HORVU1Hr1G053400.53 , HORVU1Hr1G053400.52 , HORVU1Hr1G053400.50 , HORVU1Hr1G053400.45 , HORVU1Hr1G053400.46 , HORVU1Hr1G053400.40 , HORVU1Hr1G053400.42 , HORVU1Hr1G053400.49 , HORVU1Hr1G053400.38 , HORVU1Hr1G053400.35 , HORVU1Hr1G053400.37 , HORVU1Hr1G053400.8 , HORVU1Hr1G053400.3 , HORVU1Hr1G053400.7 , HORVU1Hr1G053400.6 , HORVU1Hr1G053400.4 , HORVU1Hr1G053400.13 , HORVU1Hr1G053400.12 , HORVU1Hr1G053400.11 , HORVU1Hr1G053400.14 , HORVU1Hr1G053400.36
Wheat TraesCS5D02G417900 , TraesCS5B02G412900 , TraesCS1B02G223100 , TraesCS1B02G223100 , TraesCS5A02G408000 , TraesCS1A02G208900 , TraesCS1D02G212200 , TraesCS1D02G212200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G305100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G305100--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic001G305100--Sobic003G266100 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G305100--Sobic005G082300 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic001G305100--Sobic002G059500 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic001G305100--Sobic001G511400 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G305100--Sobic002G300900 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic001G305100--Sobic006G040101 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G305100--Sobic002G172100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G305100--Sobic005G147500 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic003G266100--Sobic002G172200 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic002G172100 Sobic003G266100--Sobic003G294800 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic003G266100--Sobic008G159300 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic005G082300 Sobic003G266100--Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G082300--Sobic006G081400 Sobic002G059500--Sobic006G040101 Sobic002G059500--Sobic002G300900 Sobic002G059500--Sobic003G266100 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic002G059500--Sobic005G035500 Sobic002G059500--Sobic006G004100 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G059500--Sobic007G025100 Sobic002G059500--Sobic001G511400 Sobic002G059500--Sobic008G159300 Sobic002G059500--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic006G040101--Sobic002G059500 Sobic006G040101--Sobic002G300900 Sobic006G040101--Sobic007G025100 Sobic006G040101--Sobic005G035500 Sobic006G040101--Sobic003G266100 Sobic006G040101--Sobic001G297700 Sobic006G040101--Sobic001G511400 Sobic006G040101--Sobic002G172200 Sobic006G040101--Sobic006G004100 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300
Octagon: transcription factors


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