Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G327200.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S8S5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G084400 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G197000 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K10717: cytokinin trans-hydroxylase
3 Sobic.006G171100 expansin precursor, putative, expressed -
4 Sobic.002G274600 glycosyl transferase family 8 protein, expressed -
5 Sobic.001G153100 sulfate transporter, putative, expressed K17470: sulfate transporter 1, high-affinity
6 Sobic.008G105800 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.005G069166 - -
8 Sobic.006G230100 TKL_IRAK_DUF26-ld.1 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
9 Sobic.005G069332 - -
10 Sobic.001G415100 terpene synthase, putative, expressed -
11 Sobic.007G015000 methyltransferase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G063700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
14 Sobic.001G293100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.005G216600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G136800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
17 Sobic.004G299500 - -
18 Sobic.006G229901 - -
19 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
20 Sobic.006G121000 purine permease, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G327200 Sobic001G327200 Sobic009G084400 Sobic009G084400 Sobic001G327200--Sobic009G084400 Sobic002G197000 Sobic002G197000 Sobic001G327200--Sobic002G197000 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic001G327200--Sobic006G171100 Sobic002G274600 Sobic002G274600 Sobic001G327200--Sobic002G274600 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic001G327200--Sobic001G153100 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic001G327200--Sobic008G105800 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic001G327200--Sobic005G069166 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic001G327200--Sobic006G230100 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic001G327200--Sobic005G069332 Sobic009G084400--Sobic002G197000 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic009G084400--Sobic002G029500 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic009G084400--Sobic010G213600 Sobic009G084400--Sobic002G274600 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic009G084400--Sobic002G391300 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic009G084400--Sobic005G134200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic009G084400--Sobic005G226400 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic009G084400--Sobic006G092100 Sobic009G084400--Sobic006G171100 Sobic002G197000--Sobic009G084400 Sobic002G197000--Sobic002G029500 Sobic002G197000--Sobic002G274600 Sobic002G197000--Sobic006G230100 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic002G197000--Sobic007G064900 Sobic002G197000--Sobic006G092100 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic002G197000--Sobic004G299500 Sobic002G197000--Sobic005G226400 Sobic006G059800 Sobic006G059800 Sobic002G197000--Sobic006G059800 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic006G171100--Sobic009G136800 Sobic006G171100--Sobic002G391300 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic006G171100--Sobic010G010000 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic006G171100--Sobic003G441601 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic006G171100--Sobic002G111900 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic006G171100--Sobic005G046400 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic006G171100--Sobic002G289500 Sobic006G171100--Sobic005G226400 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic006G171100--Sobic006G047200 Sobic002G274600--Sobic009G084400 Sobic002G274600--Sobic002G197000 Sobic004G079900 Sobic004G079900 Sobic002G274600--Sobic004G079900 Sobic002G274600--Sobic010G010000 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic002G274600--Sobic004G014600 Sobic001G218400 Sobic001G218400 Sobic002G274600--Sobic001G218400 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic002G274600--Sobic002G029600 Sobic002G274600--Sobic006G171100 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic002G274600--Sobic005G106300 Sobic007G202480 Sobic007G202480 Sobic001G153100--Sobic007G202480 Sobic001G153100--Sobic005G069166 Sobic001G153100--Sobic006G230100 Sobic001G153100--Sobic004G299500 Sobic006G229901 Sobic006G229901 Sobic001G153100--Sobic006G229901 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic001G153100--Sobic002G063700 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic001G153100--Sobic001G395900 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic001G153100--Sobic001G415100 Sobic001G153100--Sobic002G289500 Sobic009G055300 Sobic009G055300 Sobic008G105800--Sobic009G055300 Sobic008G105800--Sobic005G069332 Sobic008G105800--Sobic005G069166 Sobic008G105800--Sobic007G202480 Sobic008G105800--Sobic006G230100 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic008G105800--Sobic005G216400 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic008G105800--Sobic006G121000 Sobic008G105800--Sobic004G299500 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic008G105800--Sobic006G230200 Sobic005G069166--Sobic004G299500 Sobic005G069166--Sobic005G069332 Sobic005G069166--Sobic006G230100 Sobic005G069166--Sobic007G202480 Sobic005G069166--Sobic001G153100 Sobic005G069166--Sobic006G229901 Sobic005G069166--Sobic008G105800 Sobic005G069166--Sobic001G395900 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic005G069166--Sobic007G015000 Sobic006G230100--Sobic004G299500 Sobic006G230100--Sobic001G395900 Sobic006G230100--Sobic007G202480 Sobic006G230100--Sobic007G015000 Sobic006G230100--Sobic005G069166 Sobic006G230100--Sobic009G055300 Sobic006G230100--Sobic006G230200 Sobic006G230100--Sobic001G153100 Sobic006G230100--Sobic006G229901 Sobic005G069332--Sobic005G069166 Sobic005G069332--Sobic004G299500 Sobic005G069332--Sobic008G105800 Sobic005G069332--Sobic006G230100 Sobic005G069332--Sobic007G202480 Sobic005G069332--Sobic002G063700 Sobic005G069332--Sobic009G055300 Sobic005G069332--Sobic001G395900 Sobic005G069332--Sobic006G230200
Octagon: transcription factors


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