Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G345800.1
Synonym Sb01g033165
Functional annotation zinc-binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S962
Pfam PF04640
Panther DB PTHR31065 PTHR31065:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G60670 : PLATZ transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g02790.1 : zinc-binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G349600 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
2 Sobic.006G194800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G141700 - -
4 Sobic.003G415700 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G238300 - -
6 Sobic.002G332600 - -
7 Sobic.007G041000 expressed protein -
8 Sobic.002G352401 - -
9 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.005G080800 - -
11 Sobic.002G058000 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
12 Sobic.005G130900 expressed protein -
13 Sobic.001G349600 cyclin, putative, expressed K18810: cyclin D1/2/4, plant
14 Sobic.002G031200 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G120100 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G399700 pectinesterase, putative, expressed -
17 Sobic.010G191400 - -
18 Sobic.005G223300 DEFL16 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
19 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.002G058100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1


Gene co-expression network
sample Sobic001G345800 Sobic001G345800 Sobic002G349600 Sobic002G349600 Sobic001G345800--Sobic002G349600 Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic001G345800--Sobic006G194800 Sobic005G141700 Sobic005G141700 Sobic001G345800--Sobic005G141700 Sobic003G415700 Sobic003G415700 Sobic001G345800--Sobic003G415700 Sobic006G238300 Sobic006G238300 Sobic001G345800--Sobic006G238300 Sobic002G332600 Sobic002G332600 Sobic001G345800--Sobic002G332600 Sobic007G041000 Sobic007G041000 Sobic001G345800--Sobic007G041000 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic001G345800--Sobic002G352401 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic001G345800--Sobic004G315900 Sobic002G349600--Sobic005G141700 Sobic002G349600--Sobic006G194800 Sobic002G349600--Sobic001G345800 Sobic002G349600--Sobic003G415700 Sobic002G349600--Sobic007G041000 Sobic002G349600--Sobic002G352401 Sobic002G349600--Sobic002G332600 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic002G349600--Sobic005G147100 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic002G349600--Sobic010G010500 Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic006G194800--Sobic010G191450 Sobic006G194800--Sobic002G349600 Sobic006G194800--Sobic002G332600 Sobic006G194800--Sobic007G041000 Sobic006G194800--Sobic005G141700 Sobic004G221600 Sobic004G221600 Sobic006G194800--Sobic004G221600 Sobic006G194800--Sobic002G352401 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic006G194800--Sobic005G223300 Sobic006G194800--Sobic004G315900 Sobic005G141700--Sobic002G349600 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G141700--Sobic005G147200 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic005G141700--Sobic005G221100 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G141700--Sobic005G223000 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G141700--Sobic008G045650 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic005G141700--Sobic010G191500 Sobic005G141700--Sobic002G332600 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic005G141700--Sobic005G145900 Sobic005G141700--Sobic005G147100 Sobic003G415700--Sobic006G238300 Sobic005G152700 Sobic005G152700 Sobic003G415700--Sobic005G152700 Sobic003G415700--Sobic002G349600 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic003G415700--Sobic004G090400 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic003G415700--Sobic002G345500 Sobic003G415700--Sobic002G352401 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic003G415700--Sobic006G144101 Sobic004G221700 Sobic004G221700 Sobic003G415700--Sobic004G221700 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic003G415700--Sobic003G411100 Sobic006G238300--Sobic003G415700 Sobic006G238300--Sobic005G152700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic006G238300--Sobic005G200400 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic006G238300--Sobic002G162100 Sobic006G238300--Sobic004G090400 Sobic006G238300--Sobic006G144101 Sobic006G238300--Sobic002G352401 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic006G238300--Sobic005G153300 Sobic006G238300--Sobic002G345500 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic002G332600--Sobic001G209701 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic007G041000--Sobic005G080800 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic007G041000--Sobic005G130900 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic007G041000--Sobic002G399700 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic007G041000--Sobic001G349600 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic007G041000--Sobic002G058000 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic007G041000--Sobic005G154000 Sobic007G041000--Sobic004G315900 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic007G041000--Sobic005G027200 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic007G041000--Sobic010G191400 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000
Octagon: transcription factors


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