Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G531600.2,Sobic.001G531600.4,Sobic.001G531600.3
Synonym Sb01g049460
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X105
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g05810.1,LOC_Os02g05810.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G531600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G418800 - -
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10 Sobic.002G244901 - -
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16 Sobic.010G210050 - -
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20 Sobic.005G095000 -(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1


Gene co-expression network
sample Sobic001G531600 Sobic001G531600 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G531600--Sobic002G418800 Sobic009G045500 Sobic009G045500 Sobic001G531600--Sobic009G045500 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic001G531600--Sobic008G122100 Sobic002G196800 Sobic002G196800 Sobic001G531600--Sobic002G196800 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic001G531600--Sobic009G216200 Sobic009G101800 Sobic009G101800 Sobic001G531600--Sobic009G101800 Sobic002G345900 Sobic002G345900 Sobic001G531600--Sobic002G345900 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic001G531600--Sobic009G248801 Sobic010G118500 Sobic010G118500 Sobic001G531600--Sobic010G118500 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic002G418800--Sobic001G459600 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic002G418800--Sobic001G000501 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic002G418800--Sobic005G089400 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic002G418800--Sobic008G166550 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic002G418800--Sobic004G034600 Sobic001G517800 Sobic001G517800 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Octagon: transcription factors


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