Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G491900.1
Synonym Sb01g045990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WWU0
Pfam PF11360
Panther DB PTHR37178 PTHR37178:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13990 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g07190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053352
Brachypodium KQK23449
Barley -
Wheat TraesCS4B02G283700 , TraesCS4D02G282500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G491900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G295900 cell division cycle protein 23, putative, expressed K03355: APC8, anaphase-promoting complex subunit 8
2 Sobic.006G088450 - -
3 Sobic.003G133700 transporter, major facilitator family, putative, expressed K08193: MFS transporter, ACS family, solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), other
4 Sobic.001G033800 expressed protein -
5 Sobic.008G016400 - -
6 Sobic.006G165700 - -
7 Sobic.004G273550 - -
8 Sobic.002G259900 expressed protein -
9 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
10 Sobic.009G149600 transmembrane protein 18, putative, expressed -
11 Sobic.005G068400 - -
12 Sobic.010G249600 macrophage migration inhibitory factor, putative, expressed -
13 Sobic.003G278633 - -
14 Sobic.006G118150 - -
15 Sobic.007G077466 - -
16 Sobic.003G283000 expressed protein -
17 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G007200 - -
19 Sobic.007G138200 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G036366 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G491900 Sobic001G491900 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic001G491900--Sobic004G295900 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic001G491900--Sobic006G088450 Sobic003G133700 Sobic003G133700 Sobic001G491900--Sobic003G133700 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic001G491900--Sobic001G033800 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic001G491900--Sobic008G016400 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic001G491900--Sobic006G165700 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic001G491900--Sobic004G273550 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic001G491900--Sobic002G259900 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic001G491900--Sobic002G288500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic004G295900--Sobic005G068400 Sobic004G295900--Sobic006G088450 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G295900--Sobic010G249600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic004G295900--Sobic007G226000 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic004G295900--Sobic009G149600 Sobic004G295900--Sobic002G288500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic004G295900--Sobic005G135300 Sobic004G295900--Sobic001G033800 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic004G295900--Sobic007G185000 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic003G050800 Sobic003G050800 Sobic003G133700--Sobic003G050800 Sobic006G074500 Sobic006G074500 Sobic003G133700--Sobic006G074500 Sobic006G101600 Sobic006G101600 Sobic003G133700--Sobic006G101600 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic003G133700--Sobic004G224000 Sobic002G430100 Sobic002G430100 Sobic003G133700--Sobic002G430100 Sobic003G133700--Sobic010G249600 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic003G133700--Sobic007G077466 Sobic001G184300 Sobic001G184300 Sobic003G133700--Sobic001G184300 Sobic009G213900 Sobic009G213900 Sobic003G133700--Sobic009G213900 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic001G033800--Sobic002G358200 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic001G033800--Sobic009G036366 Sobic001G033800--Sobic004G295900 Sobic001G033800--Sobic002G288500 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic001G033800--Sobic010G210050 Sobic001G033800--Sobic006G088450 Sobic001G033800--Sobic009G149600 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic001G033800--Sobic002G104500 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G033800--Sobic003G159400 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic008G016400--Sobic001G424650 Sobic008G016400--Sobic007G077466 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic008G016400--Sobic006G118150 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic008G016400--Sobic009G183650 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic008G016400--Sobic001G212900 Sobic008G016400--Sobic009G149600 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic004G224000 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic008G016400--Sobic001G492400 Sobic006G165700--Sobic006G118150 Sobic006G165700--Sobic008G016400 Sobic006G165700--Sobic004G224000 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G165700--Sobic001G503700 Sobic006G165700--Sobic009G149600 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G165700--Sobic003G149400 Sobic006G165700--Sobic007G226000 Sobic006G165700--Sobic007G077466 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic006G165700--Sobic009G223000 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic004G273550--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic004G273550--Sobic007G224700 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic008G153300 Sobic004G273550--Sobic006G118150 Sobic004G273550--Sobic007G077466 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic004G273550--Sobic002G274000 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G079700 Sobic004G273550--Sobic009G183650 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic004G273550--Sobic004G007200 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic002G259900--Sobic003G278633 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic002G259900--Sobic003G443601 Sobic002G259900--Sobic008G016400 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic002G259900--Sobic009G216200 Sobic002G259900--Sobic006G118150 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic002G259900--Sobic008G141700 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic002G259900--Sobic007G138200 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G259900--Sobic006G151100 Sobic002G259900--Sobic007G224700 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic004G295900
Octagon: transcription factors


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