Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G118500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJM4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012291
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G102900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G279601 - -
3 Sobic.001G542150 - -
4 Sobic.005G133600 - -
5 Sobic.001G475100 expressed protein -
6 Sobic.010G137100 - -
7 Sobic.008G044900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
8 Sobic.001G233300 - -
9 Sobic.008G088833 - -
10 Sobic.001G000300 - -
11 Sobic.005G150400 - -
12 Sobic.007G185300 - -
13 Sobic.004G324800 expressed protein -
14 Sobic.010G121100 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G323800 peptide chain release factor protein, putative, expressed K02836: peptide chain release factor 2
17 Sobic.004G253700 - -
18 Sobic.003G179350 - -
19 Sobic.003G251100 - -
20 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G118500 Sobic010G118500 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic010G118500--Sobic005G102900 Sobic001G279601 Sobic001G279601 Sobic010G118500--Sobic001G279601 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic010G118500--Sobic001G542150 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic010G118500--Sobic005G133600 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic010G118500--Sobic001G475100 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G118500--Sobic010G137100 Sobic008G044900 Sobic008G044900 Sobic010G118500--Sobic008G044900 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic010G118500--Sobic001G233300 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic010G118500--Sobic008G088833 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic005G102900--Sobic003G207500 Sobic005G102900--Sobic005G133600 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G102900--Sobic007G188800 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic005G102900--Sobic004G057500 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G102900--Sobic007G185300 Sobic005G102900--Sobic001G475100 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic005G102900--Sobic010G121100 Sobic010G205600 Sobic010G205600 Sobic005G102900--Sobic010G205600 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic005G102900--Sobic010G273300 Sobic001G279601--Sobic005G133600 Sobic001G279601--Sobic004G057500 Sobic001G279601--Sobic005G102900 Sobic001G279601--Sobic007G185300 Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic001G279601--Sobic001G053200 Sobic004G080100 Sobic004G080100 Sobic001G279601--Sobic004G080100 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G279601--Sobic002G249300 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G279601--Sobic001G223550 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic001G279601--Sobic001G252000 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic001G542150--Sobic005G150400 Sobic005G133600--Sobic001G223550 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G133600--Sobic009G248801 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic005G133600--Sobic008G101100 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic005G133600--Sobic004G253700 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic005G133600--Sobic003G160100 Sobic005G133600--Sobic007G185300 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G133600--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G133600--Sobic007G010700 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic005G133600--Sobic005G095000 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic001G475100--Sobic005G145550 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic001G475100--Sobic005G188300 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic001G475100--Sobic007G163001 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic006G057600 Sobic001G475100--Sobic003G207500 Sobic001G475100--Sobic010G273300 Sobic001G475100--Sobic010G121100 Sobic001G475100--Sobic007G188800 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic001G475100--Sobic008G111200 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic010G137100--Sobic010G102366 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G137100--Sobic010G135250 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic003G207500 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic004G340300 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G137100--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G137100--Sobic010G163400 Sobic001G182850 Sobic001G182850 Sobic010G137100--Sobic001G182850 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G137100--Sobic003G251100 Sobic008G044900--Sobic010G273300 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic008G044900--Sobic008G021400 Sobic005G132600 Sobic005G132600 Sobic008G044900--Sobic005G132600 Sobic008G044900--Sobic007G188800 Sobic008G044900--Sobic010G121100 Sobic008G044900--Sobic005G145550 Sobic008G044900--Sobic001G475100 Sobic001G340000 Sobic001G340000 Sobic008G044900--Sobic001G340000 Sobic008G033900 Sobic008G033900 Sobic008G044900--Sobic008G033900 Sobic001G233300--Sobic002G153200 Sobic001G233300--Sobic002G143766 Sobic001G233300--Sobic001G223550 Sobic001G233300--Sobic002G249300 Sobic001G233300--Sobic001G542150 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G233300--Sobic010G145500 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G233300--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G233300--Sobic005G149700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G233300--Sobic001G000501 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic008G088833--Sobic008G084300 Sobic008G088833--Sobic009G248801 Sobic008G101200 Sobic008G101200 Sobic008G088833--Sobic008G101200 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic008G088833--Sobic001G000300 Sobic008G088833--Sobic001G000501 Sobic008G088833--Sobic008G101100 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic008G088833--Sobic001G459600 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic008G088833--Sobic008G122100 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G088833--Sobic008G166550
Octagon: transcription factors


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