Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G014500.1
Synonym Sb02g001460
Functional annotation -
UniProt C5X7Z1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g23640.1 : retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G058600 O-methyltransferase, putative, expressed K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
2 Sobic.009G015500 - -
3 Sobic.005G064900 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.004G308300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
5 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
6 Sobic.006G181900 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
7 Sobic.006G142000 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
8 Sobic.008G108950 - -
9 Sobic.002G416500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.001G323600 transporter family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G409400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsRCI2-5 - Putative low temperature and salt responsive protein, expressed -
12 Sobic.005G088700 expressed protein -
13 Sobic.009G006500 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
14 Sobic.001G373600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
15 Sobic.003G024600 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.7 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
16 Sobic.007G164500 - -
17 Sobic.009G158600 - -
18 Sobic.010G070750 - -
19 Sobic.003G278200 potassium channel AKT1, putative, expressed -
20 Sobic.001G508400 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant


Gene co-expression network
sample Sobic002G014500 Sobic002G014500 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic002G014500--Sobic007G058600 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic002G014500--Sobic009G015500 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic002G014500--Sobic005G064900 Sobic004G308300 Sobic004G308300 Sobic002G014500--Sobic004G308300 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic002G014500--Sobic003G015200 Sobic006G181900 Sobic006G181900 Sobic002G014500--Sobic006G181900 Sobic006G142000 Sobic006G142000 Sobic002G014500--Sobic006G142000 Sobic008G108950 Sobic008G108950 Sobic002G014500--Sobic008G108950 Sobic002G416500 Sobic002G416500 Sobic002G014500--Sobic002G416500 Sobic007G058600--Sobic009G015500 Sobic007G058600--Sobic003G015200 Sobic007G058600--Sobic005G064900 Sobic001G323600 Sobic001G323600 Sobic007G058600--Sobic001G323600 Sobic007G058600--Sobic006G142000 Sobic005G088700 Sobic005G088700 Sobic007G058600--Sobic005G088700 Sobic003G024600 Sobic003G024600 Sobic007G058600--Sobic003G024600 Sobic001G373600 Sobic001G373600 Sobic007G058600--Sobic001G373600 Sobic007G164500 Sobic007G164500 Sobic007G058600--Sobic007G164500 Sobic009G015500--Sobic007G058600 Sobic009G015500--Sobic001G323600 Sobic010G070750 Sobic010G070750 Sobic009G015500--Sobic010G070750 Sobic009G015500--Sobic004G308300 Sobic009G015500--Sobic005G088700 Sobic009G158600 Sobic009G158600 Sobic009G015500--Sobic009G158600 Sobic009G015500--Sobic003G024600 Sobic009G015500--Sobic007G164500 Sobic009G015500--Sobic001G373600 Sobic005G064900--Sobic007G058600 Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic005G064900--Sobic007G156800 Sobic005G064900--Sobic009G015500 Sobic005G064900--Sobic003G015200 Sobic005G064900--Sobic005G088700 Sobic005G064900--Sobic008G108950 Sobic005G064900--Sobic001G323600 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic005G064900--Sobic004G108800 Sobic005G064900--Sobic001G373600 Sobic004G308300--Sobic007G164500 Sobic004G308300--Sobic001G323600 Sobic004G308300--Sobic003G024600 Sobic004G308300--Sobic010G070750 Sobic004G308300--Sobic001G373600 Sobic001G466450 Sobic001G466450 Sobic004G308300--Sobic001G466450 Sobic003G015200--Sobic007G058600 Sobic003G015200--Sobic004G108800 Sobic003G015200--Sobic005G064900 Sobic003G015200--Sobic009G015500 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic003G015200--Sobic005G149600 Sobic003G015200--Sobic007G156800 Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic003G015200--Sobic005G152500 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic003G015200--Sobic005G089200 Sobic009G006500 Sobic009G006500 Sobic003G015200--Sobic009G006500 Sobic009G158500 Sobic009G158500 Sobic006G181900--Sobic009G158500 Sobic006G181900--Sobic007G058600 Sobic006G181900--Sobic009G015500 Sobic001G508400 Sobic001G508400 Sobic006G181900--Sobic001G508400 Sobic006G181900--Sobic010G070750 Sobic006G181900--Sobic009G006500 Sobic006G181900--Sobic003G024600 Sobic006G181900--Sobic003G015200 Sobic006G181900--Sobic001G323600 Sobic006G142000--Sobic007G164500 Sobic006G142000--Sobic001G373600 Sobic006G142000--Sobic001G323600 Sobic006G142000--Sobic003G024600 Sobic006G142000--Sobic007G058600 Sobic006G142000--Sobic001G466450 Sobic008G108950--Sobic007G156800 Sobic008G108950--Sobic005G064900 Sobic008G108950--Sobic004G108800 Sobic008G108950--Sobic003G015200 Sobic008G108950--Sobic005G088700 Sobic008G108950--Sobic009G015500 Sobic008G108950--Sobic007G058600 Sobic007G038500 Sobic007G038500 Sobic008G108950--Sobic007G038500 Sobic008G108950--Sobic001G323600 Sobic002G416500--Sobic001G508400 Sobic002G416500--Sobic006G181900 Sobic002G389100 Sobic002G389100 Sobic002G416500--Sobic002G389100 Sobic002G416500--Sobic003G015200 Sobic002G416500--Sobic009G006500 Sobic002G416500--Sobic007G058600 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic002G416500--Sobic001G026300 Sobic001G452200 Sobic001G452200 Sobic002G416500--Sobic001G452200 Sobic004G261400 Sobic004G261400 Sobic002G416500--Sobic004G261400
Octagon: transcription factors


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