Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G055500.1,Sobic.002G055500.2
Synonym Sb02g004640,
Functional annotation Putative uncharacterized protein (Oryza sativa Indica Group) (PubMedID : 24655390)
Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
expressed protein
UniProt C5XB37
Pfam PF08268
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF93
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G075950 - -
2 Sobic.010G091366 - -
3 Sobic.001G205600 expressed protein -
4 Sobic.008G003400 OsGrx_S16 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
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10 Sobic.004G101800 osFTL13 FT-Like13 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
11 Sobic.008G104350 - -
12 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G168100 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G443850 - -
15 Sobic.010G251501 - -
16 Sobic.004G061300 expressed protein -
17 Sobic.007G183500 CC-NBS-LRR, putative, expressed -
18 Sobic.008G043450 - -
19 Sobic.003G009501 - -
20 Sobic.001G025201 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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