Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G063566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2L4
Pfam PF00931 PF13855
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD KOG0617; Ras suppressor protein (contains leucine-rich repeats)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69550 : disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46200.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G493400 , TraesCS7A02G007882
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G094400 DUF581 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G091700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
3 Sobic.010G253250 - -
4 Sobic.005G062300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.006G075650 - -
6 Sobic.002G417101 - -
7 Sobic.005G014100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
8 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.008G159200 - -
10 Sobic.007G034650 - -
11 Sobic.002G099500 expressed protein -
12 Sobic.001G218300 MATH domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G352100 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 1 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.006G218050 - -
15 Sobic.003G035266 - -
16 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
17 Sobic.005G120466 - -
18 Sobic.002G273400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@OsIAA26 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
19 Sobic.001G211101 - -
20 Sobic.003G178101 - K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP


Gene co-expression network
sample Sobic002G063566 Sobic002G063566 Sobic005G094400 Sobic005G094400 Sobic002G063566--Sobic005G094400 Sobic002G091700 Sobic002G091700 Sobic002G063566--Sobic002G091700 Sobic010G253250 Sobic010G253250 Sobic002G063566--Sobic010G253250 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic002G063566--Sobic005G062300 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic002G063566--Sobic006G075650 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic002G063566--Sobic002G417101 Sobic005G014100 Sobic005G014100 Sobic002G063566--Sobic005G014100 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic002G063566--Sobic004G121500 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic002G063566--Sobic008G159200 Sobic005G094400--Sobic002G063566 Sobic005G094400--Sobic002G091700 Sobic005G094400--Sobic010G253250 Sobic005G094400--Sobic002G417101 Sobic005G094400--Sobic005G062300 Sobic005G094400--Sobic004G121500 Sobic007G034650 Sobic007G034650 Sobic005G094400--Sobic007G034650 Sobic003G318500 Sobic003G318500 Sobic005G094400--Sobic003G318500 Sobic005G094400--Sobic006G075650 Sobic002G091700--Sobic005G094400 Sobic002G091700--Sobic002G063566 Sobic002G091700--Sobic010G253250 Sobic002G229400 Sobic002G229400 Sobic002G091700--Sobic002G229400 Sobic002G091700--Sobic005G062300 Sobic002G091700--Sobic002G417101 Sobic002G091700--Sobic004G121500 Sobic002G091700--Sobic005G014100 Sobic002G273400 Sobic002G273400 Sobic002G091700--Sobic002G273400 Sobic010G253250--Sobic005G062300 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic010G253250--Sobic001G218300 Sobic010G253250--Sobic006G075650 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic010G253250--Sobic007G086400 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic010G253250--Sobic005G120466 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic010G253250--Sobic002G099500 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic010G253250--Sobic003G095301 Sobic010G253250--Sobic002G417101 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic010G253250--Sobic005G144900 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic005G062300--Sobic005G077666 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic002G417101--Sobic004G121500 Sobic002G417101--Sobic003G095301 Sobic002G417101--Sobic005G062300 Sobic002G417101--Sobic010G253250 Sobic002G417101--Sobic005G077666 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic002G417101--Sobic001G328850 Sobic002G417101--Sobic002G099500 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G417101--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic002G417101--Sobic004G123801 Sobic005G014100--Sobic001G218300 Sobic005G014100--Sobic005G062300 Sobic005G014100--Sobic006G075650 Sobic005G014100--Sobic010G253250 Sobic005G014100--Sobic001G211101 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic005G014100--Sobic009G110300 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic005G014100--Sobic002G069700 Sobic004G264450 Sobic004G264450 Sobic005G014100--Sobic004G264450 Sobic001G352100 Sobic001G352100 Sobic005G014100--Sobic001G352100 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic006G075650 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic008G159200--Sobic003G035266 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic008G159200--Sobic005G190400 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic008G159200--Sobic005G102750 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic002G218350 Sobic008G159200--Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic005G062300 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic008G159200--Sobic003G268650
Octagon: transcription factors


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