Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G094400.1
Synonym Sb05g008190
Functional annotation DUF581 domain containing protein, expressed
UniProt C5Y1J0
Pfam PF04570
Panther DB PTHR33059 PTHR33059:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17670 : Protein of unknown function (DUF581)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46190.1 : DUF581 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056704
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G066610.2 , HORVU6Hr1G066610.1 , HORVU6Hr1G066610.3
Wheat TraesCS6B02G289300 , TraesCS6D02G242700 , TraesCS6A02G262000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G063566 - -
2 Sobic.002G091700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
3 Sobic.010G253250 - -
4 Sobic.002G417101 - -
5 Sobic.005G062300 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
7 Sobic.007G034650 - -
8 Sobic.003G318500 - -
9 Sobic.006G075650 - -
10 Sobic.002G099500 expressed protein -
11 Sobic.001G352100 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 1 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.005G014100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
13 Sobic.001G218300 MATH domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G086400 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
15 Sobic.006G141900 expressed protein -
16 Sobic.005G120466 - -
17 Sobic.006G218050 - -
18 Sobic.002G229400 OsSCP43 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
19 Sobic.008G159200 - -
20 Sobic.001G173251 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G094400 Sobic005G094400 Sobic002G063566 Sobic002G063566 Sobic005G094400--Sobic002G063566 Sobic002G091700 Sobic002G091700 Sobic005G094400--Sobic002G091700 Sobic010G253250 Sobic010G253250 Sobic005G094400--Sobic010G253250 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic005G094400--Sobic002G417101 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic005G094400--Sobic005G062300 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic005G094400--Sobic004G121500 Sobic007G034650 Sobic007G034650 Sobic005G094400--Sobic007G034650 Sobic003G318500 Sobic003G318500 Sobic005G094400--Sobic003G318500 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic005G094400--Sobic006G075650 Sobic002G063566--Sobic005G094400 Sobic002G063566--Sobic002G091700 Sobic002G063566--Sobic010G253250 Sobic002G063566--Sobic005G062300 Sobic002G063566--Sobic006G075650 Sobic002G063566--Sobic002G417101 Sobic005G014100 Sobic005G014100 Sobic002G063566--Sobic005G014100 Sobic002G063566--Sobic004G121500 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic002G063566--Sobic008G159200 Sobic002G091700--Sobic005G094400 Sobic002G091700--Sobic002G063566 Sobic002G091700--Sobic010G253250 Sobic002G229400 Sobic002G229400 Sobic002G091700--Sobic002G229400 Sobic002G091700--Sobic005G062300 Sobic002G091700--Sobic002G417101 Sobic002G091700--Sobic004G121500 Sobic002G091700--Sobic005G014100 Sobic002G273400 Sobic002G273400 Sobic002G091700--Sobic002G273400 Sobic010G253250--Sobic005G062300 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic010G253250--Sobic001G218300 Sobic010G253250--Sobic006G075650 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic010G253250--Sobic007G086400 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic010G253250--Sobic005G120466 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic010G253250--Sobic002G099500 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic010G253250--Sobic003G095301 Sobic010G253250--Sobic002G417101 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic010G253250--Sobic005G144900 Sobic002G417101--Sobic004G121500 Sobic002G417101--Sobic003G095301 Sobic002G417101--Sobic005G062300 Sobic002G417101--Sobic010G253250 Sobic005G077666 Sobic005G077666 Sobic002G417101--Sobic005G077666 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic002G417101--Sobic001G328850 Sobic002G417101--Sobic002G099500 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G417101--Sobic007G181801 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic002G417101--Sobic004G123801 Sobic005G062300--Sobic006G075650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G211101 Sobic005G062300--Sobic001G218300 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G062300--Sobic003G178101 Sobic005G062300--Sobic005G120466 Sobic005G062300--Sobic002G099500 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G062300--Sobic003G384650 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic006G218050 Sobic005G062300--Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic002G417101 Sobic004G121500--Sobic005G062300 Sobic004G121500--Sobic005G077666 Sobic004G121500--Sobic003G095301 Sobic004G121500--Sobic001G328850 Sobic004G121500--Sobic007G181801 Sobic004G121500--Sobic004G123801 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic004G121500--Sobic002G175000 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic004G121500--Sobic009G219601 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic007G034650--Sobic001G185700 Sobic007G034650--Sobic002G099500 Sobic007G034650--Sobic001G328850 Sobic007G034650--Sobic005G120466 Sobic007G034650--Sobic003G384650 Sobic007G034650--Sobic003G178101 Sobic003G154600 Sobic003G154600 Sobic007G034650--Sobic003G154600 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic007G034650--Sobic004G171350 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic007G034650--Sobic008G031800 Sobic003G318500--Sobic005G094400 Sobic005G191000 Sobic005G191000 Sobic003G318500--Sobic005G191000 Sobic007G020800 Sobic007G020800 Sobic003G318500--Sobic007G020800 Sobic003G318500--Sobic002G063566 Sobic003G318500--Sobic005G062300 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic003G318500--Sobic001G302000 Sobic010G151050 Sobic010G151050 Sobic003G318500--Sobic010G151050 Sobic005G222300 Sobic005G222300 Sobic003G318500--Sobic005G222300 Sobic003G318500--Sobic010G253250 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic006G075650--Sobic002G218350
Octagon: transcription factors


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