Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G166000.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W4G3
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01260.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207700 - -
2 Sobic.005G114201 - -
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12 Sobic.005G220500 pollen allergen, putative, expressed -
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14 Sobic.007G167000 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
15 Sobic.002G414300 - -
16 Sobic.001G488950 - -
17 Sobic.001G269700 - -
18 Sobic.005G214800 - -
19 Sobic.001G246001 - K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.001G269600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G166000 Sobic002G166000 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic002G166000--Sobic005G207700 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic002G166000--Sobic005G114201 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic002G166000--Sobic007G129800 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic002G166000--Sobic007G095333 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic002G166000--Sobic010G107800 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic002G166000--Sobic005G220400 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic002G166000--Sobic009G110800 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic002G166000--Sobic001G269200 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic002G166000--Sobic002G414000 Sobic005G207700--Sobic009G110800 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic005G207700--Sobic006G043101 Sobic005G207700--Sobic002G414000 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic005G207700--Sobic005G214800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic005G207700--Sobic001G246001 Sobic005G207700--Sobic001G269200 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic005G207700--Sobic005G220500 Sobic005G207700--Sobic010G107800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G207700--Sobic003G445300 Sobic005G114201--Sobic007G095333 Sobic005G114201--Sobic005G220400 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic005G114201--Sobic010G215000 Sobic005G114201--Sobic007G129800 Sobic005G114201--Sobic002G414000 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic005G114201--Sobic002G194300 Sobic005G114201--Sobic003G445300 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic005G114201--Sobic002G082400 Sobic005G114201--Sobic006G043101 Sobic007G129800--Sobic010G107800 Sobic007G129800--Sobic001G269200 Sobic002G414300 Sobic002G414300 Sobic007G129800--Sobic002G414300 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic007G129800--Sobic007G167000 Sobic007G129800--Sobic002G414000 Sobic007G129800--Sobic005G220500 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic007G129800--Sobic001G269700 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic007G129800--Sobic001G269600 Sobic007G129800--Sobic006G043101 Sobic007G095333--Sobic005G220400 Sobic007G095333--Sobic010G215000 Sobic007G095333--Sobic002G194300 Sobic007G095333--Sobic005G114201 Sobic007G095333--Sobic002G414000 Sobic007G095333--Sobic003G445300 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic007G095333--Sobic007G160501 Sobic007G095333--Sobic006G043101 Sobic007G095333--Sobic001G246001 Sobic010G107800--Sobic007G129800 Sobic010G107800--Sobic001G269200 Sobic010G107800--Sobic007G167000 Sobic010G107800--Sobic002G414300 Sobic010G107800--Sobic002G414000 Sobic010G107800--Sobic005G220500 Sobic010G107800--Sobic001G269700 Sobic010G107800--Sobic001G269600 Sobic010G107800--Sobic006G043101 Sobic005G220400--Sobic003G445300 Sobic005G220400--Sobic002G082400 Sobic005G220400--Sobic002G414000 Sobic005G220400--Sobic005G220500 Sobic005G220400--Sobic006G043101 Sobic005G220400--Sobic001G269200 Sobic005G220400--Sobic005G214800 Sobic005G220400--Sobic001G246001 Sobic005G220400--Sobic010G215000 Sobic009G110800--Sobic001G246001 Sobic009G110800--Sobic005G214800 Sobic009G110800--Sobic007G160501 Sobic009G110800--Sobic002G414000 Sobic009G110800--Sobic006G043101 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G351100 Sobic009G110800--Sobic003G445300 Sobic009G110800--Sobic005G220400 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic009G110800--Sobic008G125801 Sobic001G269200--Sobic005G220500 Sobic001G269200--Sobic010G107800 Sobic001G269200--Sobic007G129800 Sobic001G269200--Sobic002G414000 Sobic001G269200--Sobic002G082400 Sobic001G269200--Sobic007G167000 Sobic001G269200--Sobic003G445300 Sobic001G269200--Sobic006G043101 Sobic001G269200--Sobic005G220400 Sobic002G414000--Sobic006G043101 Sobic002G414000--Sobic005G214800 Sobic002G414000--Sobic001G246001 Sobic002G414000--Sobic005G220400 Sobic002G414000--Sobic001G269200 Sobic002G414000--Sobic003G445300 Sobic002G414000--Sobic005G220500 Sobic002G414000--Sobic010G107800 Sobic002G414000--Sobic002G082400
Octagon: transcription factors


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