Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G251600.1
Synonym Sb02g028740
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt C5X4J0
Pfam PF01095
Panther DB PTHR31707 PTHR31707:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01051; pectinesterase
Gene Ontology GO:0005618; cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G43270 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34900.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G376000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G148201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G251600 Sobic002G251600 Sobic001G183100 Sobic001G183100 Sobic002G251600--Sobic001G183100 Sobic002G101500 Sobic002G101500 Sobic002G251600--Sobic002G101500 Sobic007G069300 Sobic007G069300 Sobic002G251600--Sobic007G069300 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic002G251600--Sobic003G103100 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic002G251600--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic002G251600--Sobic008G184500 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic002G251600--Sobic002G105900 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic002G251600--Sobic005G227151 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic002G251600--Sobic005G052200 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic001G183100--Sobic008G184000 Sobic001G183100--Sobic005G227151 Sobic001G183100--Sobic002G105900 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic001G183100--Sobic004G207500 Sobic001G183100--Sobic004G029700 Sobic001G183100--Sobic008G184500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic001G183100--Sobic003G326300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic001G183100--Sobic003G099900 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic001G183100--Sobic002G273000 Sobic002G101500--Sobic005G227151 Sobic002G101500--Sobic002G105900 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic002G101500--Sobic003G319050 Sobic002G101500--Sobic004G029700 Sobic002G101500--Sobic008G184500 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G101500--Sobic006G142850 Sobic002G101500--Sobic008G184000 Sobic002G101500--Sobic004G207500 Sobic002G101500--Sobic003G099900 Sobic004G326700 Sobic004G326700 Sobic007G069300--Sobic004G326700 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic007G069300--Sobic009G020000 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic007G069300--Sobic004G114700 Sobic007G069300--Sobic005G052200 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic007G069300--Sobic004G316300 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic007G069300--Sobic005G042400 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic007G069300--Sobic004G008700 Sobic007G069300--Sobic003G103100 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic007G069300--Sobic002G098100 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic004G029700--Sobic008G184500 Sobic004G029700--Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic002G105900 Sobic004G029700--Sobic005G227151 Sobic004G029700--Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic008G184000 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G029700--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic003G099900 Sobic008G184500--Sobic004G029700 Sobic008G184500--Sobic003G103100 Sobic008G184500--Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic003G319050 Sobic008G184500--Sobic005G227151 Sobic008G184500--Sobic008G184000 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic002G097100 Sobic008G184500--Sobic002G007300 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic005G052200--Sobic004G114700 Sobic005G052200--Sobic004G316300 Sobic005G052200--Sobic003G103100 Sobic005G052200--Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic005G042400 Sobic005G052200--Sobic002G098100 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic004G008700 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic005G052200--Sobic003G099800
Octagon: transcription factors


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