Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G284300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QDV7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G331200 - -
2 Sobic.001G214400 - -
3 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
4 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
5 Sobic.003G101600 - -
6 Sobic.008G166250 - -
7 Sobic.009G094000 - -
8 Sobic.007G016300 - -
9 Sobic.008G112400 - -
10 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
11 Sobic.004G302550 - -
12 Sobic.004G269500 transcription factor TF2, putative, expressed -
13 Sobic.004G200000 expressed protein -
14 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G001900 expressed protein -
16 Sobic.002G114600 - -
17 Sobic.005G083866 - -
18 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.010G035300 WRKY73, expressed -
20 Sobic.010G001700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic002G284300--Sobic002G331200 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic002G284300--Sobic001G214400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic002G284300--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G284300--Sobic004G177400 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic002G284300--Sobic003G101600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G284300--Sobic008G166250 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G284300--Sobic009G094000 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic002G284300--Sobic007G016300 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G284300--Sobic008G112400 Sobic002G331200--Sobic007G016300 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic002G331200--Sobic005G083866 Sobic002G331200--Sobic002G284300 Sobic002G331200--Sobic001G214400 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic002G331200--Sobic004G200000 Sobic002G331200--Sobic008G112400 Sobic002G331200--Sobic009G094000 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic009G151500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G331200--Sobic003G043650 Sobic001G214400--Sobic009G151500 Sobic001G214400--Sobic002G331200 Sobic010G001700 Sobic010G001700 Sobic001G214400--Sobic010G001700 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic004G200000 Sobic001G214400--Sobic002G284300 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic001G214400--Sobic010G009532 Sobic001G214400--Sobic003G043650 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic001G214400--Sobic002G018133 Sobic008G173700--Sobic004G177400 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G173700--Sobic004G302550 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic008G173700--Sobic008G064900 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G173700--Sobic005G091400 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic008G173700--Sobic001G541166 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic008G173700--Sobic006G222650 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic008G173700--Sobic005G001600 Sobic008G173700--Sobic008G112400 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic008G173700--Sobic004G211501 Sobic004G177400--Sobic004G302550 Sobic004G177400--Sobic008G173700 Sobic004G177400--Sobic006G222650 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic004G177400--Sobic004G302400 Sobic010G035300 Sobic010G035300 Sobic004G177400--Sobic010G035300 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic004G177400--Sobic002G065300 Sobic004G177400--Sobic004G211501 Sobic004G177400--Sobic005G091400 Sobic004G177400--Sobic008G064900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic003G101600--Sobic004G314750 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic003G101600--Sobic008G164525 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic003G101600--Sobic006G094400 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic003G101600--Sobic001G434450 Sobic003G101600--Sobic009G094000 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic003G101600--Sobic004G001900 Sobic002G133600 Sobic002G133600 Sobic003G101600--Sobic002G133600 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic003G101600--Sobic002G114600 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic003G101600--Sobic002G165401 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic009G094000 Sobic009G094000--Sobic001G434450 Sobic009G094000--Sobic006G094400 Sobic009G094000--Sobic004G314750 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic009G094000--Sobic006G256801 Sobic009G094000--Sobic008G164525 Sobic009G094000--Sobic004G001900 Sobic009G094000--Sobic002G165401 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic009G094000--Sobic004G279150 Sobic009G094000--Sobic003G101600 Sobic007G016300--Sobic004G200000 Sobic007G016300--Sobic002G331200 Sobic007G016300--Sobic005G083866 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic008G112400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G016300--Sobic002G008701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G016300--Sobic004G260700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic007G016300--Sobic001G345366 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600
Octagon: transcription factors


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