Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G285001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W625
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G050000 expressed protein -
2 Sobic.008G025550 - -
3 Sobic.008G059700 expressed protein -
4 Sobic.008G076100 expressed protein -
5 Sobic.001G325850 - -
6 Sobic.004G036400 Ca exchanger 2(PubMedID : 22196357)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K07300: chaA, Ca2+:H+ antiporter
7 Sobic.002G384900 expressed protein -
8 Sobic.001G188100 expressed protein K15191: La-related protein 7
9 Sobic.006G017700 expressed protein -
10 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G182701 - -
13 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.005G221675 - -
15 Sobic.002G156400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@MDR-like ABC transporter, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
16 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G036100 expressed protein -
19 Sobic.008G138400 expressed protein -
20 Sobic.002G192800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G285001 Sobic002G285001 Sobic002G050000 Sobic002G050000 Sobic002G285001--Sobic002G050000 Sobic008G025550 Sobic008G025550 Sobic002G285001--Sobic008G025550 Sobic008G059700 Sobic008G059700 Sobic002G285001--Sobic008G059700 Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic002G285001--Sobic008G076100 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic002G285001--Sobic001G325850 Sobic004G036400 Sobic004G036400 Sobic002G285001--Sobic004G036400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G285001--Sobic002G384900 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic002G285001--Sobic001G188100 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic002G285001--Sobic006G017700 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G050000--Sobic005G058300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic002G050000--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic002G050000--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic002G050000--Sobic004G046700 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G050000--Sobic006G224400 Sobic007G167950 Sobic007G167950 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Octagon: transcription factors


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